RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chst8Q8BQ86 417 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BWQ6 963 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nuak2Q8BZN4 639 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdelr3Q8R1L4 214 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RhoqQ8R527 205 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lsm1Q8VC85 133 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem161aQ8VCA6 480 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1311Q8VET0 312 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt2b38Q91WH2 530 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GlyatQ91XE0 296 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gjd3Q91YD1 278 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AassQ99K67 926 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fars2Q99M01 451 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C1qtnf3Q9ES30 246 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cog8Q9JJA2 640 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pin1Q9QUR7 165 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hacl1Q9QXE0 581 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2g1Q9WV19 494 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5483B2RV77 97 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mybpc1D3YU50 1127 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4871D3Z0W7 314 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cilp2D3Z7H8 1162 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pate1E9Q658 125 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20441G3UYJ7 252 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsmce4aG3XA30 381 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ackr2O08707 378 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Orm2P07361 207 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpa3P15089 417 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tap1P21958 724 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gp1bbP56400 206 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd1P58544 488 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabarapl2P60521 117 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Isl1P61372 349 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vbp1P61759 196 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnk2P97438 426 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crisp1Q03401 244 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf865Q3U3I9 1058 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc16a10Q3U9N9 512 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnks2Q3UES3 1166 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr149Q3UVY1 732 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem247Q497K7 211 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpc1Q61056 793 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ManealQ6P1J0 452 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr366Q7TRY4 309 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zmpste24Q80W54 475 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpped1Q8BFS6 312 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr171Q8BG55 319 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpina3bQ8BYY9 420 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gykl1Q8C635 549 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim31Q8R0K2 507 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cox18Q8VC74 331 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtmr14Q8VEL2 648 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gorasp1Q91X51 446 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc44a3Q921V7 656 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prmt3Q922H1 532 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Marc2Q922Q1 338 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fuca2Q99KR8 461 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9CZV2 255 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2610042L04RikQ9D073 150 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gbe1Q9D6Y9 702 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmprss6Q9DBI0 811 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmg20aQ9DC33 346 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trhr2Q9ERT2 382 aa6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vwa8Q8CC88 1905 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CroccQ8CJ40 2009 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Faap100A2ACJ2 879 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1006A2ALD2 312 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad21l1A2AU37 552 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12800B1AUV4 484 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dlgap4B1AZP2 992 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr414E9Q5P8 317 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C6E9Q6D8 931 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alkal1J3QPP8 127 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c68K7N6C2 491 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12794L7MTS5 483 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MaffO54791 156 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr50O88495 591 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GzmcP08882 248 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gstm1P10649 218 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esr1P19785 599 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr5a2P45448 560 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox2P48432 319 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl1P61211 181 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 YwhahP68510 246 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Emx1Q04742 257 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 StradaQ3UUJ4 431 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UrgcpQ5NCI0 926 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BadQ61337 204 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcna5Q61762 602 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Avpr1aQ62463 423 aa6.49□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap97Q6ZPR1 541 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.5 ms