Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR8

Fuca2, Plasma alpha-L-fucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fuca2Q99KR8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Fuca2Q99KR8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Fuca2Q99KR8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Fuca2Q99KR8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Fuca2Q99KR8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Fuca2Q99KR8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Fuca2Q99KR8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fuca2Q99KR8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fuca2Q99KR8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Fuca2Q99KR8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fuca2Q99KR8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fuca2Q99KR8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Fuca2Q99KR8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Fuca2Q99KR8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fuca2Q99KR8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fuca2Q99KR8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Fuca2Q99KR8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fuca2Q99KR8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fuca2Q99KR8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fuca2Q99KR8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Fuca2Q99KR8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fuca2Q99KR8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fuca2Q99KR8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fuca2Q99KR8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fuca2Q99KR8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fuca2Q99KR8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fuca2Q99KR8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fuca2Q99KR8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fuca2Q99KR8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fuca2Q99KR8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fuca2Q99KR8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fuca2Q99KR8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Fuca2Q99KR8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fuca2Q99KR8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fuca2Q99KR8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Fuca2Q99KR8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Fuca2Q99KR8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fuca2Q99KR8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fuca2Q99KR8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fuca2Q99KR8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fuca2Q99KR8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fuca2Q99KR8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fuca2Q99KR8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fuca2Q99KR8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fuca2Q99KR8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fuca2Q99KR8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Fuca2Q99KR8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fuca2Q99KR8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fuca2Q99KR8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fuca2Q99KR8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fuca2Q99KR8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Fuca2Q99KR8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fuca2Q99KR8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Fuca2Q99KR8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fuca2Q99KR8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fuca2Q99KR8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Fuca2Q99KR8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Fuca2Q99KR8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fuca2Q99KR8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Fuca2Q99KR8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fuca2Q99KR8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fuca2Q99KR8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fuca2Q99KR8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fuca2Q99KR8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Fuca2Q99KR8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fuca2Q99KR8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fuca2Q99KR8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fuca2Q99KR8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fuca2Q99KR8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fuca2Q99KR8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fuca2Q99KR8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fuca2Q99KR8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fuca2Q99KR8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fuca2Q99KR8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fuca2Q99KR8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Fuca2Q99KR8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fuca2Q99KR8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fuca2Q99KR8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fuca2Q99KR8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fuca2Q99KR8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fuca2Q99KR8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fuca2Q99KR8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fuca2Q99KR8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fuca2Q99KR8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fuca2Q99KR8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fuca2Q99KR8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Fuca2Q99KR8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fuca2Q99KR8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Fuca2Q99KR8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fuca2Q99KR8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fuca2Q99KR8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fuca2Q99KR8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fuca2Q99KR8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Fuca2Q99KR8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fuca2Q99KR8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Fuca2Q99KR8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Fuca2Q99KR8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fuca2Q99KR8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Fuca2Q99KR8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fuca2Q99KR8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms