Protein–RNA interactions for Protein: D3YU50

Mybpc1, Myosin-binding protein C, slow-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc1D3YU50 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Mybpc1D3YU50 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mybpc1D3YU50 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Mybpc1D3YU50 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Mybpc1D3YU50 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Mybpc1D3YU50 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Mybpc1D3YU50 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Mybpc1D3YU50 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Mybpc1D3YU50 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Mybpc1D3YU50 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Mybpc1D3YU50 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mybpc1D3YU50 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mybpc1D3YU50 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mybpc1D3YU50 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Mybpc1D3YU50 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Mybpc1D3YU50 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Mybpc1D3YU50 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mybpc1D3YU50 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mybpc1D3YU50 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mybpc1D3YU50 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mybpc1D3YU50 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mybpc1D3YU50 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mybpc1D3YU50 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mybpc1D3YU50 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mybpc1D3YU50 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mybpc1D3YU50 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Mybpc1D3YU50 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mybpc1D3YU50 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mybpc1D3YU50 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mybpc1D3YU50 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mybpc1D3YU50 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Mybpc1D3YU50 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mybpc1D3YU50 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mybpc1D3YU50 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mybpc1D3YU50 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mybpc1D3YU50 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mybpc1D3YU50 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mybpc1D3YU50 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mybpc1D3YU50 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mybpc1D3YU50 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Mybpc1D3YU50 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mybpc1D3YU50 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mybpc1D3YU50 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mybpc1D3YU50 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Mybpc1D3YU50 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mybpc1D3YU50 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mybpc1D3YU50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mybpc1D3YU50 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mybpc1D3YU50 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mybpc1D3YU50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mybpc1D3YU50 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mybpc1D3YU50 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Mybpc1D3YU50 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mybpc1D3YU50 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mybpc1D3YU50 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mybpc1D3YU50 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mybpc1D3YU50 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mybpc1D3YU50 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mybpc1D3YU50 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mybpc1D3YU50 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mybpc1D3YU50 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mybpc1D3YU50 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mybpc1D3YU50 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Mybpc1D3YU50 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mybpc1D3YU50 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mybpc1D3YU50 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mybpc1D3YU50 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mybpc1D3YU50 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mybpc1D3YU50 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mybpc1D3YU50 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mybpc1D3YU50 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mybpc1D3YU50 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mybpc1D3YU50 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mybpc1D3YU50 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mybpc1D3YU50 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mybpc1D3YU50 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mybpc1D3YU50 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mybpc1D3YU50 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mybpc1D3YU50 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mybpc1D3YU50 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mybpc1D3YU50 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mybpc1D3YU50 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mybpc1D3YU50 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mybpc1D3YU50 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mybpc1D3YU50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mybpc1D3YU50 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mybpc1D3YU50 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mybpc1D3YU50 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mybpc1D3YU50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mybpc1D3YU50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mybpc1D3YU50 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Mybpc1D3YU50 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mybpc1D3YU50 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mybpc1D3YU50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mybpc1D3YU50 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mybpc1D3YU50 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mybpc1D3YU50 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mybpc1D3YU50 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mybpc1D3YU50 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Mybpc1D3YU50 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms