Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUR7

Pin1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1Q9QUR7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Pin1Q9QUR7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pin1Q9QUR7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pin1Q9QUR7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pin1Q9QUR7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pin1Q9QUR7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pin1Q9QUR7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Pin1Q9QUR7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Pin1Q9QUR7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pin1Q9QUR7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Pin1Q9QUR7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pin1Q9QUR7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Pin1Q9QUR7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Pin1Q9QUR7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pin1Q9QUR7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pin1Q9QUR7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pin1Q9QUR7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pin1Q9QUR7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pin1Q9QUR7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pin1Q9QUR7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pin1Q9QUR7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pin1Q9QUR7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pin1Q9QUR7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pin1Q9QUR7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pin1Q9QUR7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pin1Q9QUR7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pin1Q9QUR7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Pin1Q9QUR7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pin1Q9QUR7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pin1Q9QUR7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pin1Q9QUR7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pin1Q9QUR7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pin1Q9QUR7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pin1Q9QUR7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pin1Q9QUR7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pin1Q9QUR7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pin1Q9QUR7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pin1Q9QUR7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pin1Q9QUR7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pin1Q9QUR7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Pin1Q9QUR7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pin1Q9QUR7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pin1Q9QUR7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pin1Q9QUR7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pin1Q9QUR7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pin1Q9QUR7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pin1Q9QUR7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pin1Q9QUR7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pin1Q9QUR7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pin1Q9QUR7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pin1Q9QUR7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pin1Q9QUR7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pin1Q9QUR7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pin1Q9QUR7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pin1Q9QUR7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pin1Q9QUR7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pin1Q9QUR7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pin1Q9QUR7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pin1Q9QUR7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pin1Q9QUR7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pin1Q9QUR7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pin1Q9QUR7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pin1Q9QUR7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Pin1Q9QUR7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pin1Q9QUR7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pin1Q9QUR7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pin1Q9QUR7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pin1Q9QUR7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pin1Q9QUR7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pin1Q9QUR7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pin1Q9QUR7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pin1Q9QUR7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Pin1Q9QUR7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pin1Q9QUR7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pin1Q9QUR7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pin1Q9QUR7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pin1Q9QUR7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pin1Q9QUR7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pin1Q9QUR7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pin1Q9QUR7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pin1Q9QUR7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pin1Q9QUR7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pin1Q9QUR7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pin1Q9QUR7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pin1Q9QUR7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pin1Q9QUR7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pin1Q9QUR7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pin1Q9QUR7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pin1Q9QUR7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pin1Q9QUR7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pin1Q9QUR7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pin1Q9QUR7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pin1Q9QUR7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pin1Q9QUR7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pin1Q9QUR7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pin1Q9QUR7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pin1Q9QUR7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pin1Q9QUR7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pin1Q9QUR7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pin1Q9QUR7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms