Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Arl1P61211 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Arl1P61211 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Arl1P61211 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Arl1P61211 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Arl1P61211 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Arl1P61211 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Arl1P61211 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Arl1P61211 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Arl1P61211 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Arl1P61211 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arl1P61211 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Arl1P61211 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Arl1P61211 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Arl1P61211 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Arl1P61211 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Arl1P61211 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Arl1P61211 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arl1P61211 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Arl1P61211 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Arl1P61211 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Arl1P61211 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Arl1P61211 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Arl1P61211 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arl1P61211 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arl1P61211 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arl1P61211 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Arl1P61211 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Arl1P61211 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arl1P61211 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arl1P61211 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arl1P61211 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Arl1P61211 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Arl1P61211 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Arl1P61211 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arl1P61211 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arl1P61211 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arl1P61211 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arl1P61211 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arl1P61211 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Arl1P61211 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arl1P61211 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Arl1P61211 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arl1P61211 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arl1P61211 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arl1P61211 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Arl1P61211 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Arl1P61211 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arl1P61211 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arl1P61211 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arl1P61211 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arl1P61211 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Arl1P61211 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arl1P61211 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arl1P61211 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Arl1P61211 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Arl1P61211 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Arl1P61211 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arl1P61211 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arl1P61211 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arl1P61211 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Arl1P61211 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arl1P61211 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arl1P61211 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arl1P61211 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arl1P61211 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arl1P61211 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arl1P61211 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arl1P61211 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arl1P61211 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arl1P61211 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arl1P61211 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arl1P61211 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arl1P61211 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Arl1P61211 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Arl1P61211 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Arl1P61211 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arl1P61211 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arl1P61211 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arl1P61211 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Arl1P61211 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Arl1P61211 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arl1P61211 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arl1P61211 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arl1P61211 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Arl1P61211 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arl1P61211 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arl1P61211 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arl1P61211 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arl1P61211 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Arl1P61211 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arl1P61211 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arl1P61211 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arl1P61211 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Arl1P61211 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Arl1P61211 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arl1P61211 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arl1P61211 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Arl1P61211 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arl1P61211 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms