RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454561.2

TRBV5-4-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV5-4, Length 544 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4-201ENST00000454561 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 MPP5Q8N3R9 675 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ELMO1Q92556 727 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 C9orf72Q96LT7 481 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 CARD6Q9BX69 1037 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 RAB33BQ9H082 229 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 COG4Q9H9E3 785 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 KCND1Q9NSA2 647 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SYBUQ9NX95 663 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 OGFRQ9NZT2 677 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 RNF14Q9UBS8 474 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 KLHL3Q9UH77 587 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SOX13Q9UN79 622 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 EFCAB7A8K855 629 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 KLK10O43240 276 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRAMEF10O60809 474 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 RASSF9O75901 435 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PAMP19021 973 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PTGIRP43119 386 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 CAPZBP47756 277 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PREPP48147 710 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 RAB15P59190 212 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 MC2RQ01718 297 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 BRD3Q15059 726 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 IRGCQ6NXR0 463 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 XKR5Q6UX68 686 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PCGF5Q86SE9 256 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM129CQ86XR2 697 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PHC3Q8NDX5 983 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 GPR150Q8NGU9 434 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 LCN9Q8WX39 176 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 RSC1A1Q92681 617 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SLCO2A1Q92959 643 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ART4Q93070 314 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 MFSD3Q96ES6 412 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 TGM7Q96PF1 710 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 TCF12Q99081 682 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 HRASLS2Q9NWW9 162 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 LHX6Q9UPM6 363 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
TRBV5-4-201ENST00000454561 SVILO95425 2214 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR6C74A6NCV1 312 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 C9orf172C9J069 976 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 CCDC188H7C350 402 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 KPNA5O15131 536 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM63AO94886 807 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 APOA4P06727 396 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 ITGB6P18564 788 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
TRBV5-4-201ENST00000454561 ACADLP28330 430 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms