RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 NTMT1Q9BV86 223 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 STK16O75716 305 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 CIB2O75838 187 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 MATN4O95460 622 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SOD1P00441 154 aa15.93■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 PSMD8P48556 350 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 GALK1P51570 392 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 METAP1P53582 386 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 DDIASQ8IXT1 998 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SMRP1Q8NCR6 262 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 NAT14Q8WUY8 206 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 C3orf30Q96M34 536 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 THTPAQ9BU02 230 aa15.93■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 ASB1Q9Y576 335 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 CKAP5Q14008 2032 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 OR7A17O14581 309 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 VEGFDO43915 354 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 IDO1P14902 403 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 EPB42P16452 691 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ITGAXP20702 1163 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TEAD1P28347 426 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 GPR1P46091 355 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 HSPA7P48741 367 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 CCNG1P51959 295 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 CHPFQ8IZ52 775 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TSPEARQ8WU66 669 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TMEM159Q96B96 161 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ACOX2Q99424 681 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SLC32A1Q9H598 525 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ARL15Q9NXU5 204 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 POLG2Q9UHN1 485 aa15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 ANKRD12Q6UB98 2062 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TMEM265A0A087WTH1 108 aa15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 K7EQS6 105 aa15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 MTX2O75431 263 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 OR4F21O95013 312 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 SMU1Q2TAY7 513 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SYTL3Q4VX76 610 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 METTL6Q8TCB7 284 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ATL1Q8WXF7 558 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ESAMQ96AP7 390 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 KCNA7Q96RP8 456 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SERPINI1Q99574 410 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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