RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PPC1	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934		I3L4J1	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RHOD	O00212	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN3	O60637	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NEURL1	O76050	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	METTL18	O95568	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CALCA	P01258	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GALT	P07902	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SKIL	P12757	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HNF1B	P35680	557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	BRCC3	P46736	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TTC3	P53804	2025 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZBED6	P86452	979 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DSC1	Q08554	894 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PMPCA	Q10713	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GRIK3	Q13003	919 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CUL2	Q13617	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SHH	Q15465	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ALF	Q53S48	1182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ESX1	Q8N693	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	EME1	Q96AY2	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TBATA	Q96M53	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CHP1	Q99653	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		H0YGN5	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CYB561D2	O14569	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HCRT	O43612	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	B3GAT3	O94766	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GFPT2	O94808	682 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GJB5	O95377	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CBX6	O95503	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CD58	P19256	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PRKCH	P24723	683 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LMO2	P25791	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PGM1	P36871	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PBX3	P40426	434 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	USP8	P40818	1118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	STAT1	P42224	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN9	P43378	593 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	OR1G1	P47890	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MTNR1A	P48039	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC11A1	P49279	550 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TAF6	P49848	677 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MFAP3	P55082	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GCNT1	Q02742	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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