RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	20.8	■□□□□ 0.92
LINS1-210	ENST00000560934	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		20.47	■□□□□ 0.87
LINS1-210	ENST00000560934	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
LINS1-210	ENST00000560934	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	17.54	■□□□□ 0.4
LINS1-210	ENST00000560934	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		16.7	■□□□□ 0.26
LINS1-210	ENST00000560934	FOXD1	Q16676	465 aa		16.32	■□□□□ 0.2
LINS1-210	ENST00000560934	ADRA2B	P18089	450 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LINS1-210	ENST00000560934	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LINS1-210	ENST00000560934	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
LINS1-210	ENST00000560934	MSH5	O43196	834 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LINS1-210	ENST00000560934	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LINS1-210	ENST00000560934	KCNA4	P22459	653 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LINS1-210	ENST00000560934	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
LINS1-210	ENST00000560934	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	14.42	□□□□□ -0.1
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	14.4	□□□□□ -0.1
LINS1-210	ENST00000560934	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		14.29	□□□□□ -0.12
LINS1-210	ENST00000560934	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
LINS1-210	ENST00000560934	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		14.05	□□□□□ -0.16
LINS1-210	ENST00000560934	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
LINS1-210	ENST00000560934	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
LINS1-210	ENST00000560934	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LINS1-210	ENST00000560934	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LINS1-210	ENST00000560934	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		13.64	□□□□□ -0.23
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB22	O15209	634 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINS1-210	ENST00000560934	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINS1-210	ENST00000560934	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LINS1-210	ENST00000560934	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LINS1-210	ENST00000560934	POTED	Q86YR6	584 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LINS1-210	ENST00000560934	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
LINS1-210	ENST00000560934	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LINS1-210	ENST00000560934		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
LINS1-210	ENST00000560934	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		12.89	□□□□□ -0.35
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
LINS1-210	ENST00000560934	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
LINS1-210	ENST00000560934	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
LINS1-210	ENST00000560934	RNF39	Q9H2S5	420 aa		12.8	□□□□□ -0.36
LINS1-210	ENST00000560934	APLP2	Q06481	763 aa		12.67	□□□□□ -0.38
LINS1-210	ENST00000560934	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
LINS1-210	ENST00000560934	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
LINS1-210	ENST00000560934	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
LINS1-210	ENST00000560934	CAPN15	O75808	1086 aa		12.58	□□□□□ -0.4
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
LINS1-210	ENST00000560934	POLA2	Q14181	598 aa		12.41	□□□□□ -0.42
LINS1-210	ENST00000560934	ABCB7	O75027	752 aa		12.38	□□□□□ -0.43
LINS1-210	ENST00000560934	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP8	Q14318	412 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LINS1-210	ENST00000560934	DSG3	P32926	999 aa		12.28	□□□□□ -0.44
LINS1-210	ENST00000560934	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
LINS1-210	ENST00000560934	FBLN2	P98095	1184 aa		12.22	□□□□□ -0.45
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
LINS1-210	ENST00000560934	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.08	□□□□□ -0.48
LINS1-210	ENST00000560934	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		11.96	□□□□□ -0.49
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
LINS1-210	ENST00000560934	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LINS1-210	ENST00000560934	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LINS1-210	ENST00000560934	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LINS1-210	ENST00000560934	PROM2	Q8N271	834 aa		11.85	□□□□□ -0.51
LINS1-210	ENST00000560934	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.78	□□□□□ -0.52
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.75	□□□□□ -0.53
LINS1-210	ENST00000560934	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
LINS1-210	ENST00000560934	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LINS1-210	ENST00000560934	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LINS1-210	ENST00000560934	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
LINS1-210	ENST00000560934	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.57	□□□□□ -0.56
LINS1-210	ENST00000560934	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
LINS1-210	ENST00000560934	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		11.54	□□□□□ -0.56
LINS1-210	ENST00000560934	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
LINS1-210	ENST00000560934	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LINS1-210	ENST00000560934	MIER1	Q8N108	512 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LINS1-210	ENST00000560934	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LINS1-210	ENST00000560934	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LINS1-210	ENST00000560934	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LINS1-210	ENST00000560934	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LINS1-210	ENST00000560934	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHG5	O94827	1062 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LINS1-210	ENST00000560934	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LINS1-210	ENST00000560934	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LINS1-210	ENST00000560934	PKD2	Q13563	968 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINS1-210	ENST00000560934	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINS1-210	ENST00000560934	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LINS1-210	ENST00000560934	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LINS1-210	ENST00000560934	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINS1-210	ENST00000560934	NUBP1	P53384	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LINS1-210	ENST00000560934	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LINS1-210	ENST00000560934	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
LINS1-210	ENST00000560934	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LINS1-210	ENST00000560934	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LINS1-210	ENST00000560934	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	11.05	□□□□□ -0.64
LINS1-210	ENST00000560934	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.05	□□□□□ -0.64
LINS1-210	ENST00000560934	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
LINS1-210	ENST00000560934	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.04	□□□□□ -0.64
LINS1-210	ENST00000560934	GSE1	Q14687	1217 aa		11.02	□□□□□ -0.65
LINS1-210	ENST00000560934	RGL2	O15211	777 aa		11	□□□□□ -0.65
LINS1-210	ENST00000560934	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LINS1-210	ENST00000560934	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66

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