RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488773.1

SFT2D1-205, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene SFT2D1, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-205ENST00000488773 SQSTM1Q13501 440 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 LAMB3Q13751 1172 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ITGA9Q13797 1035 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NR1D2Q14995 579 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 LONRF2Q1L5Z9 754 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ARMC3Q5W041 872 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 FAM129CQ86XR2 697 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SLC35F6Q8N357 371 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 DDHD1Q8NEL9 900 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PEX13Q92968 403 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 OR2M4Q96R27 311 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 RANBP9Q96S59 729 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 APOL2Q9BQE5 337 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 DDA1Q9BW61 102 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SPATA16Q9BXB7 569 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ATXN10Q9UBB4 475 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SNX12Q9UMY4 172 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PKP3Q9Y446 797 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.5□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SDK2Q58EX2 2172 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 KLHL33A6NCF5 533 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 A6NCN8 305 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 USP27XA6NNY8 438 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 B4DGG1 531 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 F5H423 210 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 KMOO15229 486 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ZW10O43264 779 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 B4GAT1O43505 415 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 UGT1A9O60656 530 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 KATNA1O75449 491 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SRP72O76094 671 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ASMTLO95671 621 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 IFNB1P01574 187 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ETS1P14921 441 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 TCP1P17987 556 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 UGT1A6P19224 532 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 UGT1A1P22309 533 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 UGT1A4P22310 534 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ADRA1DP25100 572 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 MPSTP25325 297 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 FASLGP48023 281 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 KCNJ1P48048 391 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 RAB15P59190 212 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 B4GALNT1Q00973 533 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ACVR1Q04771 509 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ABHD18Q0P651 414 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 CDH17Q12864 832 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NFATC2Q13469 925 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 BIRC2Q13490 618 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 OLIG2Q13516 323 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SNX1Q13596 522 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 ERV3-1Q14264 604 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 SPARCL1Q14515 664 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 PTPRCAPQ14761 206 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 NR6A1Q15406 480 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 CHRNA6Q15825 494 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 GPR33Q49SQ1 333 aa5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SFT2D1-205ENST00000488773 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms