RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534131.1

CTSC-209, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-209	ENST00000534131	CD151	P48509	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	BRD3	Q15059	726 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TMED2	Q15363	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	FAM153C	Q494X1	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PPM1N	Q8N819	430 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	GLMN	Q92990	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CPNE1	Q99829	537 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	RIPK2	O43353	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	OR1I1	O60431	355 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	HAUS5	O94927	633 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TRIM16	O95361	564 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	APOA4	P06727	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	MYBL2	P10244	700 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	ACP5	P13686	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CHRM3	P20309	590 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	IDS	P22304	550 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	GP5	P40197	560 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	MSH2	P43246	934 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PRLHR	P49683	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	SLC12A2	P55011	1212 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	MPP1	Q00013	466 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CTBS	Q01459	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	BNC1	Q01954	994 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	LGSN	Q5TDP6	509 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	ELMO1	Q92556	727 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TCEAL3	Q969E4	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	SCAMP1	O15126	338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	VPS26A	O75436	327 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	AHSG	P02765	367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	INHBA	P08476	426 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	DGKA	P23743	735 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CA5A	P35218	305 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	ACTR1B	P42025	376 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	HAL	P42357	657 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CLCNKA	P51800	687 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	CTSC	P53634	463 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	ACTR1A	P61163	376 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	ARHGAP8	P85298	464 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	IL9R	Q01113	521 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	BNIP3	Q12983	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	BIRC2	Q13490	618 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	C1orf61	Q13536	156 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSC-209	ENST00000534131	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms