RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040111.9

Ttc28-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Ttc28, Length 10,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28-201ENSMUST00000040111 CenplQ3U3S3 329 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Bpifb1Q61114 474 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 DazlQ64368 298 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 VwdeQ6DFV8 926 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 FicdQ8BIX9 458 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Prkaa2Q8BRK8 552 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Wwp1Q8BZZ3 918 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 BroxQ8K2Q7 411 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr273Q8VG87 317 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr45Q8VGM1 311 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Adgre4Q91ZE5 689 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gprc5bQ923Z0 410 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Slc26a5Q99NH7 744 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mgrn1Q9D074 532 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zbed3Q9D0L1 228 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Krt81Q9ERE2 481 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Slc28a3Q9ERH8 703 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Cdh22Q9WTP5 813 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Slc16a8O35308 492 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rasa2P58069 847 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Stt3bQ3TDQ1 823 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rbl1Q64701 1063 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Stard13Q923Q2 1113 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 CoprsQ9CQ13 173 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 TtpalQ9D3D0 343 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ak1Q9R0Y5 194 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm6460F6YJZ8 199 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AmacrO09174 381 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pitpnm1O35954 1243 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Hsf2P38533 535 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AcadlP51174 430 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 DsppP97399 934 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Snx32Q80ZJ7 404 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 MslnlQ8C160 685 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Sgpl1Q8R0X7 568 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Asz1Q8VD46 475 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Slc44a3Q921V7 656 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ssr2Q9CPW5 183 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Abca17E9PX95 1733 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Map2k3O09110 347 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Hcn4O70507 1186 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AboP38649 332 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rab2aP53994 212 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Clca4bQ3UW98 925 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Nt5c2Q3V1L4 560 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Slc26a2Q62273 739 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Itga2Q62469 1178 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pih1d2Q8CHR9 315 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Diras1Q91Z61 198 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 PrkxQ922R0 355 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm3604A0A087WPN2 559 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Esp31A8R0W3 114 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gtpbp1O08582 668 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 PrnpP04925 254 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Camk2bP28652 542 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Lrrn4P59383 733 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ppp1r26Q6A025 1163 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Calm4Q9JM83 148 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm597E9Q8J5 896 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm3336J3QMQ6 198 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm3476K7N6V0 257 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 MttpO08601 894 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfp759Q7M6X3 721 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Q8BHB7 409 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Phf11aQ8BVM9 293 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Lrrc4cQ8C031 640 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Arel1Q8CHG5 823 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zmiz2Q8CIE2 920 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfp709Q8VC29 727 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 NckipsdQ9ESJ4 714 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn2r97K7N6Z2 861 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Cpne9Q1RLL3 553 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mef2dQ63943 514 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Crtc1Q68ED7 630 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 IlkapQ8R0F6 392 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Uroc1Q8VC12 676 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Cryl1Q99KP3 319 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mat2bQ99LB6 334 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Slit2Q9R1B9 1521 aa8.7□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Nlgn4lB0F2B4 945 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Adam15O88839 864 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pim3P58750 326 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ak8Q32M07 479 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Maml1Q6T264 1020 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Trim69Q80X56 500 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 MutyhQ99P21 515 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Col3a1P08121 1464 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Btnl6A2CG22 539 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn2r94E9PZK8 818 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Alox5P48999 674 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Trpv5P69744 723 aa8.69□□□□□ -1.02
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.7 ms