Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRK8

Prkaa2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa2Q8BRK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Prkaa2Q8BRK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prkaa2Q8BRK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prkaa2Q8BRK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prkaa2Q8BRK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Prkaa2Q8BRK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Prkaa2Q8BRK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Prkaa2Q8BRK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Prkaa2Q8BRK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Prkaa2Q8BRK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Prkaa2Q8BRK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Prkaa2Q8BRK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Prkaa2Q8BRK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prkaa2Q8BRK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prkaa2Q8BRK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Prkaa2Q8BRK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Prkaa2Q8BRK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prkaa2Q8BRK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Prkaa2Q8BRK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prkaa2Q8BRK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prkaa2Q8BRK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prkaa2Q8BRK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prkaa2Q8BRK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prkaa2Q8BRK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prkaa2Q8BRK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Prkaa2Q8BRK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prkaa2Q8BRK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prkaa2Q8BRK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prkaa2Q8BRK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prkaa2Q8BRK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prkaa2Q8BRK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prkaa2Q8BRK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prkaa2Q8BRK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prkaa2Q8BRK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkaa2Q8BRK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prkaa2Q8BRK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkaa2Q8BRK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkaa2Q8BRK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prkaa2Q8BRK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkaa2Q8BRK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkaa2Q8BRK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prkaa2Q8BRK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prkaa2Q8BRK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prkaa2Q8BRK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prkaa2Q8BRK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Prkaa2Q8BRK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prkaa2Q8BRK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkaa2Q8BRK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkaa2Q8BRK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkaa2Q8BRK8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkaa2Q8BRK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkaa2Q8BRK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkaa2Q8BRK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkaa2Q8BRK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkaa2Q8BRK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prkaa2Q8BRK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkaa2Q8BRK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkaa2Q8BRK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkaa2Q8BRK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkaa2Q8BRK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prkaa2Q8BRK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkaa2Q8BRK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkaa2Q8BRK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkaa2Q8BRK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkaa2Q8BRK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkaa2Q8BRK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkaa2Q8BRK8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkaa2Q8BRK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkaa2Q8BRK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkaa2Q8BRK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkaa2Q8BRK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkaa2Q8BRK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prkaa2Q8BRK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prkaa2Q8BRK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prkaa2Q8BRK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prkaa2Q8BRK8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prkaa2Q8BRK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkaa2Q8BRK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkaa2Q8BRK8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prkaa2Q8BRK8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkaa2Q8BRK8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkaa2Q8BRK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkaa2Q8BRK8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkaa2Q8BRK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkaa2Q8BRK8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkaa2Q8BRK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkaa2Q8BRK8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkaa2Q8BRK8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkaa2Q8BRK8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkaa2Q8BRK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkaa2Q8BRK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkaa2Q8BRK8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prkaa2Q8BRK8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkaa2Q8BRK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkaa2Q8BRK8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkaa2Q8BRK8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkaa2Q8BRK8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkaa2Q8BRK8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkaa2Q8BRK8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkaa2Q8BRK8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms