Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Calm4Q9JM83 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Calm4Q9JM83 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Calm4Q9JM83 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Calm4Q9JM83 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Calm4Q9JM83 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Calm4Q9JM83 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Calm4Q9JM83 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Calm4Q9JM83 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Calm4Q9JM83 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Calm4Q9JM83 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Calm4Q9JM83 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Calm4Q9JM83 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Calm4Q9JM83 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Calm4Q9JM83 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Calm4Q9JM83 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Calm4Q9JM83 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Calm4Q9JM83 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Calm4Q9JM83 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Calm4Q9JM83 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Calm4Q9JM83 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Calm4Q9JM83 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Calm4Q9JM83 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Calm4Q9JM83 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Calm4Q9JM83 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Calm4Q9JM83 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Calm4Q9JM83 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Calm4Q9JM83 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Calm4Q9JM83 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Calm4Q9JM83 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Calm4Q9JM83 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Calm4Q9JM83 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Calm4Q9JM83 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Calm4Q9JM83 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Calm4Q9JM83 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Calm4Q9JM83 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Calm4Q9JM83 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Calm4Q9JM83 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Calm4Q9JM83 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Calm4Q9JM83 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Calm4Q9JM83 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Calm4Q9JM83 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Calm4Q9JM83 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Calm4Q9JM83 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Calm4Q9JM83 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Calm4Q9JM83 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Calm4Q9JM83 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Calm4Q9JM83 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Calm4Q9JM83 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
Calm4Q9JM83 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Calm4Q9JM83 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Calm4Q9JM83 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Calm4Q9JM83 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Calm4Q9JM83 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Calm4Q9JM83 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Calm4Q9JM83 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Calm4Q9JM83 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Calm4Q9JM83 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Calm4Q9JM83 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Calm4Q9JM83 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Calm4Q9JM83 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Calm4Q9JM83 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Calm4Q9JM83 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Calm4Q9JM83 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Calm4Q9JM83 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Calm4Q9JM83 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Calm4Q9JM83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Calm4Q9JM83 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Calm4Q9JM83 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Calm4Q9JM83 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Calm4Q9JM83 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Calm4Q9JM83 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Calm4Q9JM83 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Calm4Q9JM83 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Calm4Q9JM83 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Calm4Q9JM83 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Calm4Q9JM83 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Calm4Q9JM83 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Calm4Q9JM83 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Calm4Q9JM83 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Calm4Q9JM83 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Calm4Q9JM83 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Calm4Q9JM83 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Calm4Q9JM83 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Calm4Q9JM83 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Calm4Q9JM83 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Calm4Q9JM83 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Calm4Q9JM83 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Calm4Q9JM83 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Calm4Q9JM83 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Calm4Q9JM83 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Calm4Q9JM83 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Calm4Q9JM83 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Calm4Q9JM83 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Calm4Q9JM83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Calm4Q9JM83 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Calm4Q9JM83 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Calm4Q9JM83 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Calm4Q9JM83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Calm4Q9JM83 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms