Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Calm4Q9JM83 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calm4Q9JM83 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Calm4Q9JM83 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Calm4Q9JM83 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Calm4Q9JM83 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Calm4Q9JM83 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Calm4Q9JM83 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calm4Q9JM83 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm4Q9JM83 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Calm4Q9JM83 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calm4Q9JM83 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calm4Q9JM83 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Calm4Q9JM83 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calm4Q9JM83 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Calm4Q9JM83 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calm4Q9JM83 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calm4Q9JM83 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calm4Q9JM83 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calm4Q9JM83 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calm4Q9JM83 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calm4Q9JM83 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calm4Q9JM83 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Calm4Q9JM83 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calm4Q9JM83 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Calm4Q9JM83 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calm4Q9JM83 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calm4Q9JM83 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calm4Q9JM83 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calm4Q9JM83 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calm4Q9JM83 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calm4Q9JM83 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calm4Q9JM83 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calm4Q9JM83 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Calm4Q9JM83 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Calm4Q9JM83 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Calm4Q9JM83 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calm4Q9JM83 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Calm4Q9JM83 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calm4Q9JM83 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calm4Q9JM83 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calm4Q9JM83 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calm4Q9JM83 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calm4Q9JM83 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calm4Q9JM83 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calm4Q9JM83 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calm4Q9JM83 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calm4Q9JM83 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calm4Q9JM83 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calm4Q9JM83 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calm4Q9JM83 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calm4Q9JM83 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Calm4Q9JM83 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Calm4Q9JM83 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Calm4Q9JM83 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Calm4Q9JM83 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Calm4Q9JM83 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Calm4Q9JM83 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Calm4Q9JM83 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calm4Q9JM83 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Calm4Q9JM83 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calm4Q9JM83 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Calm4Q9JM83 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calm4Q9JM83 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calm4Q9JM83 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calm4Q9JM83 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calm4Q9JM83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calm4Q9JM83 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calm4Q9JM83 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calm4Q9JM83 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calm4Q9JM83 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calm4Q9JM83 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calm4Q9JM83 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calm4Q9JM83 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Calm4Q9JM83 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calm4Q9JM83 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Calm4Q9JM83 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Calm4Q9JM83 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Calm4Q9JM83 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Calm4Q9JM83 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Calm4Q9JM83 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calm4Q9JM83 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Calm4Q9JM83 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calm4Q9JM83 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Calm4Q9JM83 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Calm4Q9JM83 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Calm4Q9JM83 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calm4Q9JM83 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calm4Q9JM83 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calm4Q9JM83 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm4Q9JM83 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm4Q9JM83 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calm4Q9JM83 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calm4Q9JM83 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Calm4Q9JM83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calm4Q9JM83 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calm4Q9JM83 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calm4Q9JM83 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calm4Q9JM83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calm4Q9JM83 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms