Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Cpne9Q1RLL3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cpne9Q1RLL3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cpne9Q1RLL3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cpne9Q1RLL3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cpne9Q1RLL3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cpne9Q1RLL3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Cpne9Q1RLL3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cpne9Q1RLL3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Cpne9Q1RLL3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Cpne9Q1RLL3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cpne9Q1RLL3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cpne9Q1RLL3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cpne9Q1RLL3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cpne9Q1RLL3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cpne9Q1RLL3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cpne9Q1RLL3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cpne9Q1RLL3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cpne9Q1RLL3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cpne9Q1RLL3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cpne9Q1RLL3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cpne9Q1RLL3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cpne9Q1RLL3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Cpne9Q1RLL3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cpne9Q1RLL3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cpne9Q1RLL3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cpne9Q1RLL3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpne9Q1RLL3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpne9Q1RLL3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cpne9Q1RLL3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cpne9Q1RLL3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cpne9Q1RLL3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cpne9Q1RLL3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpne9Q1RLL3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cpne9Q1RLL3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cpne9Q1RLL3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cpne9Q1RLL3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpne9Q1RLL3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cpne9Q1RLL3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cpne9Q1RLL3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cpne9Q1RLL3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cpne9Q1RLL3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cpne9Q1RLL3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cpne9Q1RLL3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cpne9Q1RLL3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cpne9Q1RLL3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpne9Q1RLL3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpne9Q1RLL3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpne9Q1RLL3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpne9Q1RLL3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpne9Q1RLL3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpne9Q1RLL3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cpne9Q1RLL3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpne9Q1RLL3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpne9Q1RLL3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpne9Q1RLL3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cpne9Q1RLL3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpne9Q1RLL3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpne9Q1RLL3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cpne9Q1RLL3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpne9Q1RLL3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cpne9Q1RLL3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpne9Q1RLL3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpne9Q1RLL3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpne9Q1RLL3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpne9Q1RLL3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cpne9Q1RLL3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cpne9Q1RLL3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cpne9Q1RLL3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cpne9Q1RLL3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpne9Q1RLL3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpne9Q1RLL3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cpne9Q1RLL3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cpne9Q1RLL3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cpne9Q1RLL3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cpne9Q1RLL3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cpne9Q1RLL3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cpne9Q1RLL3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cpne9Q1RLL3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cpne9Q1RLL3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cpne9Q1RLL3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cpne9Q1RLL3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpne9Q1RLL3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpne9Q1RLL3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cpne9Q1RLL3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpne9Q1RLL3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cpne9Q1RLL3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpne9Q1RLL3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cpne9Q1RLL3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpne9Q1RLL3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cpne9Q1RLL3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cpne9Q1RLL3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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