Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Lrrn4P59383 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrn4P59383 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrrn4P59383 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrrn4P59383 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrn4P59383 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lrrn4P59383 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrrn4P59383 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lrrn4P59383 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Lrrn4P59383 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lrrn4P59383 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrrn4P59383 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrn4P59383 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrn4P59383 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lrrn4P59383 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lrrn4P59383 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lrrn4P59383 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrn4P59383 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrn4P59383 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrn4P59383 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrrn4P59383 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrn4P59383 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrn4P59383 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrn4P59383 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrn4P59383 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lrrn4P59383 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrn4P59383 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrn4P59383 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrn4P59383 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrn4P59383 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrn4P59383 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrn4P59383 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrn4P59383 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrn4P59383 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Lrrn4P59383 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrn4P59383 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrn4P59383 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrn4P59383 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrn4P59383 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrn4P59383 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrrn4P59383 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrn4P59383 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrn4P59383 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lrrn4P59383 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrn4P59383 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrn4P59383 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrn4P59383 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrn4P59383 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrn4P59383 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrn4P59383 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrn4P59383 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrrn4P59383 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrrn4P59383 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrrn4P59383 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lrrn4P59383 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrn4P59383 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrn4P59383 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrn4P59383 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lrrn4P59383 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrn4P59383 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrn4P59383 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrn4P59383 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrn4P59383 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrn4P59383 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrn4P59383 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrn4P59383 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrn4P59383 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Lrrn4P59383 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrn4P59383 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrn4P59383 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrn4P59383 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrrn4P59383 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrn4P59383 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrn4P59383 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrn4P59383 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrn4P59383 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lrrn4P59383 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrn4P59383 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrn4P59383 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrn4P59383 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrn4P59383 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrrn4P59383 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrn4P59383 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrn4P59383 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lrrn4P59383 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrn4P59383 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrn4P59383 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrn4P59383 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrn4P59383 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrn4P59383 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrn4P59383 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrn4P59383 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrn4P59383 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrn4P59383 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrn4P59383 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrn4P59383 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrrn4P59383 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrn4P59383 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrn4P59383 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrn4P59383 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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