RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485729.1

HFE-212, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 3

Gene HFE, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-212ENST00000485729 CHFRQ96EP1 664 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 MBOAT7Q96N66 472 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 SPAG5Q96R06 1193 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 RUFY1Q96T51 708 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 MMS19Q96T76 1030 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 CIPCQ9C0C6 399 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 VCX3BQ9H321 246 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 VCX3AQ9NNX9 186 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 DAPP1Q9UN19 280 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 FLNCQ14315 2725 aa4.66□□□□□ -1.66
HFE-212ENST00000485729 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 FAM149AA5PLN7 773 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ZNF197O14709 1029 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 CHADO15335 359 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 EXOC3O60645 756 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 PPP6R2O75170 966 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TMCC1O94876 653 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 SERPINF2P08697 491 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 SNHG28P0DPA3 235 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TMOD1P28289 359 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 NOVP48745 357 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 SLC26A2P50443 739 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 AP2B1P63010 937 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 PHEXP78562 749 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 XRCC4Q13426 336 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ALS2CLQ60I27 953 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 DENND2CQ68D51 928 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 CEP85Q6P2H3 762 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 GLRX5Q86SX6 157 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TRABD2AQ86V40 505 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 SMARCD2Q92925 531 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 GTF3C6Q969F1 213 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 B3GALT6Q96L58 329 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 CCDC114Q96M63 670 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TTC14Q96N46 770 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 SNX18Q96RF0 628 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 PCYT2Q99447 389 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 CGREF1Q99674 301 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 VPS16Q9H269 839 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 DCTPP1Q9H773 170 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 RMI1Q9H9A7 625 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 USP29Q9HBJ7 922 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ASIC5Q9NY37 505 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 NDUFA13Q9P0J0 144 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 SPATA7Q9P0W8 599 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 LUZP4Q9P127 313 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 COL1A2P08123 1366 aa4.65□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 FBN3Q75N90 2809 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 MGAQ8IWI9 3026 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 HMX3A6NHT5 357 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 M0QYT0 321 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 PLK4O00444 970 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 TTI1O43156 1089 aa4.64□□□□□ -1.67
HFE-212ENST00000485729 ATP9AO75110 1047 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms