RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424290.1

GTF2IP2-201, Transcript of general transcription factor IIi pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF2IP2, Length 697 nt, Biotype unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP2-201ENST00000424290 PRKAB2O43741 272 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 SCG2P13521 617 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CEACAM1P13688 526 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CD72P21854 359 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 TGM2P21980 687 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CALML3P27482 149 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 TACR3P29371 465 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ALDH3A1P30838 453 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 MAPK9P45984 424 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ADPRHP54922 357 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 GNGT1P63211 74 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 FOXF2Q12947 444 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ZBTB17Q13105 803 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 PDCLQ13371 301 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 USH1GQ495M9 461 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 Q4G0T1 1027 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ZNF484Q5JVG2 852 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ATL3Q6DD88 541 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CYB5D1Q6P9G0 228 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 BBS12Q6ZW61 710 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 OTUD6AQ7L8S5 288 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CUL5Q93034 780 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ARRDC3Q96B67 414 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ZNF653Q96CK0 615 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 FAM81BQ96LP2 452 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 COG8Q96MW5 612 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 TWNKQ96RR1 684 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CLMPQ9H6B4 373 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 RRN3Q9NYV6 651 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 KAT6AQ92794 2004 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ITPR2Q14571 2701 aa5.05□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CTAGE9A4FU28 777 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 USP27XA6NNY8 438 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 HSF2BPO75031 334 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 USP12O75317 370 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 GSTA2P09210 222 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CCDC166P0CW27 439 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 LAMP2P13473 410 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ACP5P13686 325 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 IDO1P14902 403 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 RXRAP19793 462 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 SYT1P21579 422 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CERS1P27544 350 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CD52P31358 61 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 PNPLA4P41247 253 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 HSF1Q00613 529 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CDK18Q07002 472 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 RIPK1Q13546 671 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ANKRD1Q15327 319 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 INAQ16352 499 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ALS2CLQ60I27 953 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 RTL10Q7L3V2 364 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 GALNT16Q8N428 558 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CEP70Q8NHQ1 597 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ERMNQ8TAM6 284 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 C5orf34Q96MH7 638 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 FCRL5Q96RD9 977 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 TM2D2Q9BX73 214 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 MIS12Q9H081 205 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF2IP2-201ENST00000424290 ZWILCHQ9H900 591 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms