RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtprdQ64487 1912 aa11.65□□□□□ -0.54
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stc1O55183 247 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pknox1O70477 436 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tk1P04184 233 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 ChgbP16014 677 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abce1P61222 599 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnrc1Q3TWH3 297 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr165Q3V3A3 455 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 SynaQ5G5D5 617 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znrf3Q5SSZ7 913 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp91Q62511 572 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp1b1Q64429 543 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 FicdQ8BIX9 458 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Efemp1Q8BPB5 493 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tlk1Q8C0V0 766 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Creld1Q91XD7 420 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk9Q99J95 372 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atoh8Q99NA2 322 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9D112 206 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Senp8Q9D2Z4 221 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prokr1Q9JKL1 393 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Raph1F2Z3U3 1266 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r5K7N788 911 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 MaffO54791 156 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxa4P06798 285 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnj9P48543 393 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 CartptP56388 129 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 NxnP97346 435 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtscP97821 462 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 LcorlQ3U285 600 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ggt1Q60928 568 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dlx3Q64205 287 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sarm1Q6PDS3 724 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mvb12aQ78HU3 271 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 TifaQ793I8 184 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 SheQ8BSD5 492 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bend7Q8BSV3 434 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plin5Q8BVZ1 463 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr158Q8C419 1200 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camk1gQ91VB2 477 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q99KU6 348 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbed5B2RPU8 756 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp212G3X8R7 492 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3159K7N760 267 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-M9O19442 342 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 HmbsP22907 361 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serping1P97290 504 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd80Q00609 306 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klra8Q60682 266 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itm2aQ61500 263 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 XpaQ64267 272 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kctd12Q6WVG3 327 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uts2bQ765I1 113 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fastkd5Q7TMV3 762 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim17Q7TPM3 477 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 DdnQ80TS7 710 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd9Q8BH83 326 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exd1Q8CDF7 570 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rmnd1Q8CI78 450 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 KlbQ99N32 1043 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 CabyrQ9D424 453 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prorsd1Q9D820 169 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elovl2Q9JLJ4 292 aa11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eml5Q8BQM8 1977 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf169E9Q7F2 694 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 MaxP28574 160 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ctps2P70303 586 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dok6Q2MHE5 331 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cypt4Q6P925 153 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem108Q8BHE4 574 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 ItchQ8C863 864 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf219Q8K2Y0 722 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zkscan3Q91VW9 553 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankra2Q99PE2 312 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 LipfQ9CPP7 395 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trappc5Q9CQA1 188 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acsl4Q9QUJ7 711 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdh13Q9WTR5 714 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scnn1gQ9WU39 655 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ate1Q9Z2A5 516 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 MgamB5THE2 1827 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam34A2RSG8 714 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r88E9Q235 316 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bpifa1P97361 278 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rcn1Q05186 325 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdkl4Q3TZA2 342 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ca4Q64444 305 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc8eQ66JT1 795 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dclre1bQ8C7W7 541 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm42417Q8K1D0 126 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms