Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS7

Ddn, Dendrin, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdnQ80TS7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
DdnQ80TS7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DdnQ80TS7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DdnQ80TS7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DdnQ80TS7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DdnQ80TS7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DdnQ80TS7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
DdnQ80TS7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DdnQ80TS7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DdnQ80TS7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
DdnQ80TS7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
DdnQ80TS7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DdnQ80TS7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
DdnQ80TS7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DdnQ80TS7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DdnQ80TS7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
DdnQ80TS7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DdnQ80TS7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DdnQ80TS7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DdnQ80TS7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DdnQ80TS7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DdnQ80TS7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DdnQ80TS7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DdnQ80TS7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DdnQ80TS7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DdnQ80TS7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
DdnQ80TS7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DdnQ80TS7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DdnQ80TS7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DdnQ80TS7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DdnQ80TS7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DdnQ80TS7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DdnQ80TS7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DdnQ80TS7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DdnQ80TS7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DdnQ80TS7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DdnQ80TS7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DdnQ80TS7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DdnQ80TS7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DdnQ80TS7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DdnQ80TS7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DdnQ80TS7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DdnQ80TS7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DdnQ80TS7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DdnQ80TS7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DdnQ80TS7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DdnQ80TS7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DdnQ80TS7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DdnQ80TS7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DdnQ80TS7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DdnQ80TS7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DdnQ80TS7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DdnQ80TS7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DdnQ80TS7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DdnQ80TS7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DdnQ80TS7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DdnQ80TS7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DdnQ80TS7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DdnQ80TS7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DdnQ80TS7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DdnQ80TS7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DdnQ80TS7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DdnQ80TS7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DdnQ80TS7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DdnQ80TS7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DdnQ80TS7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DdnQ80TS7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DdnQ80TS7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DdnQ80TS7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DdnQ80TS7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DdnQ80TS7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DdnQ80TS7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DdnQ80TS7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DdnQ80TS7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DdnQ80TS7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DdnQ80TS7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DdnQ80TS7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DdnQ80TS7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DdnQ80TS7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DdnQ80TS7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DdnQ80TS7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DdnQ80TS7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DdnQ80TS7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DdnQ80TS7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DdnQ80TS7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DdnQ80TS7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DdnQ80TS7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DdnQ80TS7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DdnQ80TS7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DdnQ80TS7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DdnQ80TS7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DdnQ80TS7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DdnQ80TS7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DdnQ80TS7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DdnQ80TS7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DdnQ80TS7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DdnQ80TS7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DdnQ80TS7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DdnQ80TS7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DdnQ80TS7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms