Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rcn1Q05186 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rcn1Q05186 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rcn1Q05186 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rcn1Q05186 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Rcn1Q05186 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Rcn1Q05186 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rcn1Q05186 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Rcn1Q05186 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rcn1Q05186 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rcn1Q05186 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rcn1Q05186 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rcn1Q05186 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rcn1Q05186 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rcn1Q05186 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rcn1Q05186 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rcn1Q05186 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rcn1Q05186 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rcn1Q05186 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rcn1Q05186 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rcn1Q05186 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rcn1Q05186 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rcn1Q05186 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rcn1Q05186 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rcn1Q05186 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rcn1Q05186 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rcn1Q05186 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rcn1Q05186 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rcn1Q05186 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rcn1Q05186 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rcn1Q05186 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rcn1Q05186 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rcn1Q05186 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rcn1Q05186 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rcn1Q05186 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rcn1Q05186 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rcn1Q05186 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rcn1Q05186 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rcn1Q05186 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rcn1Q05186 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rcn1Q05186 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rcn1Q05186 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rcn1Q05186 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rcn1Q05186 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rcn1Q05186 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rcn1Q05186 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rcn1Q05186 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rcn1Q05186 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rcn1Q05186 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rcn1Q05186 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rcn1Q05186 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rcn1Q05186 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rcn1Q05186 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rcn1Q05186 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rcn1Q05186 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rcn1Q05186 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rcn1Q05186 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rcn1Q05186 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rcn1Q05186 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rcn1Q05186 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rcn1Q05186 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rcn1Q05186 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rcn1Q05186 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rcn1Q05186 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rcn1Q05186 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rcn1Q05186 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rcn1Q05186 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rcn1Q05186 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rcn1Q05186 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rcn1Q05186 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rcn1Q05186 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rcn1Q05186 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rcn1Q05186 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rcn1Q05186 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rcn1Q05186 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rcn1Q05186 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rcn1Q05186 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rcn1Q05186 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rcn1Q05186 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rcn1Q05186 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rcn1Q05186 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rcn1Q05186 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rcn1Q05186 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rcn1Q05186 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rcn1Q05186 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rcn1Q05186 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rcn1Q05186 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rcn1Q05186 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rcn1Q05186 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rcn1Q05186 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rcn1Q05186 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rcn1Q05186 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rcn1Q05186 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rcn1Q05186 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rcn1Q05186 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rcn1Q05186 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rcn1Q05186 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rcn1Q05186 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rcn1Q05186 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rcn1Q05186 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms