Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
CartptP56388 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
CartptP56388 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
CartptP56388 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
CartptP56388 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
CartptP56388 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
CartptP56388 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
CartptP56388 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
CartptP56388 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
CartptP56388 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
CartptP56388 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
CartptP56388 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
CartptP56388 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
CartptP56388 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
CartptP56388 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
CartptP56388 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
CartptP56388 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
CartptP56388 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
CartptP56388 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
CartptP56388 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
CartptP56388 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
CartptP56388 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
CartptP56388 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
CartptP56388 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
CartptP56388 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
CartptP56388 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
CartptP56388 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
CartptP56388 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
CartptP56388 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
CartptP56388 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
CartptP56388 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
CartptP56388 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
CartptP56388 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,57■■■□□ 2,32
CartptP56388 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
CartptP56388 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
CartptP56388 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
CartptP56388 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
CartptP56388 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
CartptP56388 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
CartptP56388 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
CartptP56388 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
CartptP56388 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
CartptP56388 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
CartptP56388 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
CartptP56388 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
CartptP56388 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
CartptP56388 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
CartptP56388 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
CartptP56388 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
CartptP56388 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
CartptP56388 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
CartptP56388 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
CartptP56388 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
CartptP56388 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
CartptP56388 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
CartptP56388 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
CartptP56388 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,1■■■□□ 2,09
CartptP56388 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
CartptP56388 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
CartptP56388 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
CartptP56388 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
CartptP56388 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
CartptP56388 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,08
CartptP56388 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
CartptP56388 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
CartptP56388 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
CartptP56388 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
CartptP56388 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
CartptP56388 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
CartptP56388 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
CartptP56388 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,79■■■□□ 2,04
CartptP56388 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
CartptP56388 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
CartptP56388 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
CartptP56388 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
CartptP56388 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
CartptP56388 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
CartptP56388 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
CartptP56388 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
CartptP56388 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
CartptP56388 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
CartptP56388 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
CartptP56388 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
CartptP56388 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
CartptP56388 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
CartptP56388 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
CartptP56388 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,98
CartptP56388 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
CartptP56388 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
CartptP56388 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
CartptP56388 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
CartptP56388 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
CartptP56388 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
CartptP56388 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
CartptP56388 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
CartptP56388 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
CartptP56388 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
CartptP56388 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
CartptP56388 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
CartptP56388 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
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