Protein–RNA interactions for Protein: P97361

Bpifa1, BPI fold-containing family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa1P97361 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Bpifa1P97361 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Bpifa1P97361 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Bpifa1P97361 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Bpifa1P97361 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Bpifa1P97361 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Bpifa1P97361 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Bpifa1P97361 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Bpifa1P97361 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Bpifa1P97361 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Bpifa1P97361 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Bpifa1P97361 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Bpifa1P97361 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Bpifa1P97361 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Bpifa1P97361 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Bpifa1P97361 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Bpifa1P97361 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Bpifa1P97361 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Bpifa1P97361 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Bpifa1P97361 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Bpifa1P97361 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Bpifa1P97361 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Bpifa1P97361 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Bpifa1P97361 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Bpifa1P97361 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Bpifa1P97361 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Bpifa1P97361 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Bpifa1P97361 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Bpifa1P97361 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Bpifa1P97361 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Bpifa1P97361 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Bpifa1P97361 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Bpifa1P97361 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Bpifa1P97361 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Bpifa1P97361 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Bpifa1P97361 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Bpifa1P97361 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Bpifa1P97361 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Bpifa1P97361 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Bpifa1P97361 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Bpifa1P97361 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Bpifa1P97361 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Bpifa1P97361 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Bpifa1P97361 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Bpifa1P97361 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Bpifa1P97361 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bpifa1P97361 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bpifa1P97361 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Bpifa1P97361 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Bpifa1P97361 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bpifa1P97361 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Bpifa1P97361 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Bpifa1P97361 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bpifa1P97361 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bpifa1P97361 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bpifa1P97361 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bpifa1P97361 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bpifa1P97361 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Bpifa1P97361 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bpifa1P97361 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bpifa1P97361 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bpifa1P97361 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Bpifa1P97361 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bpifa1P97361 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Bpifa1P97361 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bpifa1P97361 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bpifa1P97361 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bpifa1P97361 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bpifa1P97361 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bpifa1P97361 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bpifa1P97361 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bpifa1P97361 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Bpifa1P97361 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bpifa1P97361 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bpifa1P97361 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bpifa1P97361 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bpifa1P97361 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Bpifa1P97361 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bpifa1P97361 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Bpifa1P97361 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bpifa1P97361 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bpifa1P97361 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bpifa1P97361 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bpifa1P97361 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Bpifa1P97361 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Bpifa1P97361 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bpifa1P97361 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Bpifa1P97361 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bpifa1P97361 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bpifa1P97361 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bpifa1P97361 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bpifa1P97361 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bpifa1P97361 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bpifa1P97361 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bpifa1P97361 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bpifa1P97361 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Bpifa1P97361 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bpifa1P97361 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Bpifa1P97361 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bpifa1P97361 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms