Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Hoxa4P06798 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hoxa4P06798 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hoxa4P06798 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxa4P06798 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Hoxa4P06798 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Hoxa4P06798 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hoxa4P06798 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4P06798 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Hoxa4P06798 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Hoxa4P06798 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxa4P06798 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hoxa4P06798 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Hoxa4P06798 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxa4P06798 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxa4P06798 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Hoxa4P06798 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Hoxa4P06798 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxa4P06798 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Hoxa4P06798 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4P06798 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hoxa4P06798 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Hoxa4P06798 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Hoxa4P06798 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Hoxa4P06798 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hoxa4P06798 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hoxa4P06798 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Hoxa4P06798 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hoxa4P06798 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hoxa4P06798 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Hoxa4P06798 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hoxa4P06798 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hoxa4P06798 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hoxa4P06798 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hoxa4P06798 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxa4P06798 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxa4P06798 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxa4P06798 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxa4P06798 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hoxa4P06798 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxa4P06798 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxa4P06798 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxa4P06798 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxa4P06798 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxa4P06798 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxa4P06798 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxa4P06798 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxa4P06798 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxa4P06798 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxa4P06798 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxa4P06798 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxa4P06798 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxa4P06798 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxa4P06798 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxa4P06798 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hoxa4P06798 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxa4P06798 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxa4P06798 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxa4P06798 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxa4P06798 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxa4P06798 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxa4P06798 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxa4P06798 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxa4P06798 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxa4P06798 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hoxa4P06798 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxa4P06798 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxa4P06798 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa4P06798 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa4P06798 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa4P06798 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxa4P06798 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Hoxa4P06798 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hoxa4P06798 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxa4P06798 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4P06798 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4P06798 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4P06798 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxa4P06798 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hoxa4P06798 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxa4P06798 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Hoxa4P06798 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hoxa4P06798 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxa4P06798 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hoxa4P06798 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxa4P06798 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxa4P06798 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hoxa4P06798 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa4P06798 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxa4P06798 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxa4P06798 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxa4P06798 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxa4P06798 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxa4P06798 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxa4P06798 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxa4P06798 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxa4P06798 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxa4P06798 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa4P06798 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa4P06798 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms