Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Mvb12aQ78HU3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Mvb12aQ78HU3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Mvb12aQ78HU3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Mvb12aQ78HU3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Mvb12aQ78HU3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Mvb12aQ78HU3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Mvb12aQ78HU3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Mvb12aQ78HU3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mvb12aQ78HU3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Mvb12aQ78HU3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mvb12aQ78HU3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Mvb12aQ78HU3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Mvb12aQ78HU3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Mvb12aQ78HU3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Mvb12aQ78HU3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Mvb12aQ78HU3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Mvb12aQ78HU3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Mvb12aQ78HU3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Mvb12aQ78HU3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Mvb12aQ78HU3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mvb12aQ78HU3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Mvb12aQ78HU3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Mvb12aQ78HU3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Mvb12aQ78HU3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Mvb12aQ78HU3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Mvb12aQ78HU3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Mvb12aQ78HU3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Mvb12aQ78HU3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Mvb12aQ78HU3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mvb12aQ78HU3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Mvb12aQ78HU3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Mvb12aQ78HU3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Mvb12aQ78HU3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Mvb12aQ78HU3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Mvb12aQ78HU3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mvb12aQ78HU3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Mvb12aQ78HU3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Mvb12aQ78HU3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mvb12aQ78HU3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Mvb12aQ78HU3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mvb12aQ78HU3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mvb12aQ78HU3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mvb12aQ78HU3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mvb12aQ78HU3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Mvb12aQ78HU3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Mvb12aQ78HU3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Mvb12aQ78HU3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Mvb12aQ78HU3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Mvb12aQ78HU3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mvb12aQ78HU3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mvb12aQ78HU3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mvb12aQ78HU3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mvb12aQ78HU3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mvb12aQ78HU3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mvb12aQ78HU3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Mvb12aQ78HU3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mvb12aQ78HU3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Mvb12aQ78HU3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mvb12aQ78HU3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mvb12aQ78HU3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mvb12aQ78HU3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mvb12aQ78HU3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mvb12aQ78HU3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mvb12aQ78HU3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mvb12aQ78HU3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Mvb12aQ78HU3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mvb12aQ78HU3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Mvb12aQ78HU3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mvb12aQ78HU3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mvb12aQ78HU3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mvb12aQ78HU3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mvb12aQ78HU3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mvb12aQ78HU3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mvb12aQ78HU3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mvb12aQ78HU3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mvb12aQ78HU3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mvb12aQ78HU3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mvb12aQ78HU3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mvb12aQ78HU3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mvb12aQ78HU3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mvb12aQ78HU3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mvb12aQ78HU3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mvb12aQ78HU3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Mvb12aQ78HU3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mvb12aQ78HU3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mvb12aQ78HU3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mvb12aQ78HU3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mvb12aQ78HU3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mvb12aQ78HU3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mvb12aQ78HU3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Mvb12aQ78HU3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mvb12aQ78HU3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mvb12aQ78HU3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mvb12aQ78HU3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mvb12aQ78HU3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mvb12aQ78HU3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mvb12aQ78HU3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mvb12aQ78HU3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mvb12aQ78HU3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
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