RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam83aQ8K2P2 436 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NlnQ91YP2 704 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abhd1Q9QZC8 412 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Brca1P48754 1812 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zscan5bB2RTN3 468 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acvr2bP27040 536 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PuraP42669 321 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpx3P46412 226 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smpdl3bP58242 456 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Npy2rP97295 381 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp7Q6A4J8 1103 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ca9Q8VHB5 437 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snrnp48Q9D361 337 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il22Q9JJY9 179 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msgn1Q9JK54 188 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r38G3UYA8 861 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2610008E11RikG3X964 669 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r67K7N6T2 851 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r33K7N705 861 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Capn5O08688 640 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GzmkO35205 263 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DckP43346 260 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Inpp1P49442 396 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Impdh1P50096 514 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr2iP60898 125 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serac1Q3U213 654 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pla2g4dQ50L43 825 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbl1Q64701 1063 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sephs1Q8BH69 392 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ston2Q8BZ60 895 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf668Q8K2R5 619 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkal1Q91WE6 578 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anks3Q9CZK6 655 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B4galt4Q9JJ04 344 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt5Q9R0N5 386 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbp11A9YVJ5 442 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alox8O35936 677 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp2O88623 613 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MycP01108 439 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab8aP55258 207 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnab3P97382 249 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam171bQ14CH0 825 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddx4Q61496 702 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ckmt2Q6P8J7 419 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fndc11Q80WB0 326 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TxlngQ8BHN1 524 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msantd1Q8BIL2 278 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtf2a1lQ8R4I4 468 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PlgrktQ9D3P8 147 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fundc2Q9D6K8 151 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 S100zB9EJL3 99 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01652 108 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tp53i13Q5F267 385 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nr6a1Q64249 495 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekha6Q7TQG1 1173 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam83eQ80XS7 481 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hyal5Q812F3 526 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmtc4Q8BG19 741 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp719Q8BIV1 735 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mterf2Q8BKY8 385 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrg3Q8R0T6 542 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgrf1Q8VEC3 908 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr589Q8VGV8 317 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scd3Q99PL7 359 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efcab1Q9D3N2 212 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dhx34Q9DBV3 1145 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2a12P56593 492 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sec31bQ3TZ89 1158 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcgf5Q3UK78 256 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NkaplQ5SZT7 395 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CcncQ62447 283 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim17Q7TPM3 477 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem221Q8K071 230 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IlkapQ8R0F6 392 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhb17Q91VD8 799 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AassQ99K67 926 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp6v1c2Q99L60 427 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D5Y0 588 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galk1Q9R0N0 392 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clcn5Q9WVD4 746 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr414E9Q5P8 317 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdcd5P56812 126 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prss53Q571E5 552 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hs3st5Q8BSL4 346 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Piwil2Q8CDG1 971 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc13a3Q91Y63 600 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd209eQ91ZW7 208 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo32Q9CPU7 355 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nos1apQ9D3A8 503 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pidd1Q9ERV7 915 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyhr1Q9QXA1 311 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.5 ms