RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	KIFC1	Q9BW19	673 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	POMK	Q9H5K3	350 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CASS4	Q9NQ75	786 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A0X1KG70	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		G3V2T6	193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM77	I1YAP6	450 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PDHX	O00330	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NR5A2	O00482	541 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CTDSP2	O14595	271 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLITRK5	O94991	958 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CAPN3	P20807	821 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB10	P61026	200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LIPE	Q05469	1076 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SEMA3B	Q13214	749 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	IKZF1	Q13422	519 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MTMR1	Q13613	665 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PYCR3	Q53H96	274 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LYPD8	Q6UX82	237 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FCGR1B	Q92637	280 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	BCO2	Q9BYV7	579 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		H3BMM5	538 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TCF3	P15923	654 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	AGXT	P21549	392 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TGFBR2	P37173	567 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MAGEA11	P43364	429 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NPY2R	P49146	381 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CCNA1	P78396	465 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PIGF	Q07326	219 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LBX2	Q6XYB7	198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM35A	Q86V20	835 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB43	Q86YS6	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PHOX2B	Q99453	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NUAK2	Q9H093	628 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ACSS2	Q9NR19	701 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	USP22	Q9UPT9	525 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MICAL2	O94851	1124 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	STBD1	O95210	358 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	AP2A1	O95782	977 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC4A1	P02730	911 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ALOX12	P18054	663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FCGRT	P55899	365 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNAB2	Q13303	367 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ACAP2	Q15057	778 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CA9	Q16790	459 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		Q5BKY6	102 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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