RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Rev1Q920Q2 1249 aa22.91■■□□□ 1.26
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Suds3-201ENSMUST00000086471 StambpQ9CQ26 424 aa22.9■■□□□ 1.26
Suds3-201ENSMUST00000086471 Chrnb2Q9ERK7 501 aa22.9■■□□□ 1.26
Suds3-201ENSMUST00000086471 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Suds3-201ENSMUST00000086471 Adh6aE9Q5Z6 375 aa22.9■■□□□ 1.26
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp946F6VWU8 523 aa22.9■■□□□ 1.26
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