Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM4

Coro1c, Coronin-1C, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1cQ9WUM4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Coro1cQ9WUM4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Coro1cQ9WUM4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Coro1cQ9WUM4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Coro1cQ9WUM4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Coro1cQ9WUM4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Coro1cQ9WUM4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Coro1cQ9WUM4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Coro1cQ9WUM4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Coro1cQ9WUM4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Coro1cQ9WUM4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Coro1cQ9WUM4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Coro1cQ9WUM4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Coro1cQ9WUM4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Coro1cQ9WUM4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Coro1cQ9WUM4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Coro1cQ9WUM4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Coro1cQ9WUM4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Coro1cQ9WUM4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Coro1cQ9WUM4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Coro1cQ9WUM4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Coro1cQ9WUM4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Coro1cQ9WUM4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Coro1cQ9WUM4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Coro1cQ9WUM4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Coro1cQ9WUM4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Coro1cQ9WUM4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Coro1cQ9WUM4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Coro1cQ9WUM4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Coro1cQ9WUM4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Coro1cQ9WUM4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Coro1cQ9WUM4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Coro1cQ9WUM4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Coro1cQ9WUM4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Coro1cQ9WUM4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Coro1cQ9WUM4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Coro1cQ9WUM4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Coro1cQ9WUM4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Coro1cQ9WUM4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Coro1cQ9WUM4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Coro1cQ9WUM4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Coro1cQ9WUM4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Coro1cQ9WUM4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Coro1cQ9WUM4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Coro1cQ9WUM4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Coro1cQ9WUM4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Coro1cQ9WUM4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Coro1cQ9WUM4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Coro1cQ9WUM4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Coro1cQ9WUM4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Coro1cQ9WUM4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Coro1cQ9WUM4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Coro1cQ9WUM4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Coro1cQ9WUM4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Coro1cQ9WUM4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Coro1cQ9WUM4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Coro1cQ9WUM4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Coro1cQ9WUM4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Coro1cQ9WUM4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Coro1cQ9WUM4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Coro1cQ9WUM4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Coro1cQ9WUM4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Coro1cQ9WUM4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Coro1cQ9WUM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Coro1cQ9WUM4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Coro1cQ9WUM4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Coro1cQ9WUM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Coro1cQ9WUM4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Coro1cQ9WUM4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Coro1cQ9WUM4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Coro1cQ9WUM4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Coro1cQ9WUM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Coro1cQ9WUM4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Coro1cQ9WUM4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Coro1cQ9WUM4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Coro1cQ9WUM4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Coro1cQ9WUM4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Coro1cQ9WUM4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Coro1cQ9WUM4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Coro1cQ9WUM4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Coro1cQ9WUM4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Coro1cQ9WUM4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Coro1cQ9WUM4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Coro1cQ9WUM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Coro1cQ9WUM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Coro1cQ9WUM4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Coro1cQ9WUM4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Coro1cQ9WUM4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Coro1cQ9WUM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Coro1cQ9WUM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Coro1cQ9WUM4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Coro1cQ9WUM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Coro1cQ9WUM4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Coro1cQ9WUM4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Coro1cQ9WUM4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Coro1cQ9WUM4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Coro1cQ9WUM4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Coro1cQ9WUM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Coro1cQ9WUM4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Coro1cQ9WUM4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms