Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM4

Coro1c, Coronin-1C, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1cQ9WUM4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,78■■■■□ 3,48
Coro1cQ9WUM4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Coro1cQ9WUM4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Coro1cQ9WUM4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Coro1cQ9WUM4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Coro1cQ9WUM4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Coro1cQ9WUM4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,66■■■□□ 2,82
Coro1cQ9WUM4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Coro1cQ9WUM4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Coro1cQ9WUM4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Coro1cQ9WUM4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Coro1cQ9WUM4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Coro1cQ9WUM4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Coro1cQ9WUM4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Coro1cQ9WUM4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Coro1cQ9WUM4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Coro1cQ9WUM4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Coro1cQ9WUM4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Coro1cQ9WUM4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Coro1cQ9WUM4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Coro1cQ9WUM4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Coro1cQ9WUM4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Coro1cQ9WUM4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Coro1cQ9WUM4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Coro1cQ9WUM4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Coro1cQ9WUM4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Coro1cQ9WUM4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Coro1cQ9WUM4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Coro1cQ9WUM4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Coro1cQ9WUM4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Coro1cQ9WUM4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Coro1cQ9WUM4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Coro1cQ9WUM4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Coro1cQ9WUM4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Coro1cQ9WUM4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Coro1cQ9WUM4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Coro1cQ9WUM4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Coro1cQ9WUM4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Coro1cQ9WUM4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Coro1cQ9WUM4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Coro1cQ9WUM4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Coro1cQ9WUM4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Coro1cQ9WUM4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Coro1cQ9WUM4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Coro1cQ9WUM4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Coro1cQ9WUM4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Coro1cQ9WUM4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Coro1cQ9WUM4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Coro1cQ9WUM4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Coro1cQ9WUM4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Coro1cQ9WUM4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Coro1cQ9WUM4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Coro1cQ9WUM4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Coro1cQ9WUM4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Coro1cQ9WUM4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Coro1cQ9WUM4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Coro1cQ9WUM4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Coro1cQ9WUM4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Coro1cQ9WUM4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Coro1cQ9WUM4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Coro1cQ9WUM4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Coro1cQ9WUM4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Coro1cQ9WUM4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Coro1cQ9WUM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Coro1cQ9WUM4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Coro1cQ9WUM4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Coro1cQ9WUM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Coro1cQ9WUM4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Coro1cQ9WUM4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Coro1cQ9WUM4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Coro1cQ9WUM4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Coro1cQ9WUM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Coro1cQ9WUM4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Coro1cQ9WUM4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Coro1cQ9WUM4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Coro1cQ9WUM4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Coro1cQ9WUM4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Coro1cQ9WUM4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Coro1cQ9WUM4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Coro1cQ9WUM4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Coro1cQ9WUM4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Coro1cQ9WUM4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Coro1cQ9WUM4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Coro1cQ9WUM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Coro1cQ9WUM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Coro1cQ9WUM4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Coro1cQ9WUM4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Coro1cQ9WUM4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Coro1cQ9WUM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Coro1cQ9WUM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Coro1cQ9WUM4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Coro1cQ9WUM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Coro1cQ9WUM4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Coro1cQ9WUM4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Coro1cQ9WUM4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Coro1cQ9WUM4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Coro1cQ9WUM4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Coro1cQ9WUM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Coro1cQ9WUM4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Coro1cQ9WUM4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,3 ms