Protein–RNA interactions for Protein: Q920N7

Syt12, Synaptotagmin-12, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt12Q920N7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
Syt12Q920N7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Syt12Q920N7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Syt12Q920N7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Syt12Q920N7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Syt12Q920N7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Syt12Q920N7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Syt12Q920N7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Syt12Q920N7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Syt12Q920N7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Syt12Q920N7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Syt12Q920N7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Syt12Q920N7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Syt12Q920N7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Syt12Q920N7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Syt12Q920N7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Syt12Q920N7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Syt12Q920N7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Syt12Q920N7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Syt12Q920N7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Syt12Q920N7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Syt12Q920N7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Syt12Q920N7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Syt12Q920N7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Syt12Q920N7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Syt12Q920N7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Syt12Q920N7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Syt12Q920N7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Syt12Q920N7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Syt12Q920N7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Syt12Q920N7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Syt12Q920N7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Syt12Q920N7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Syt12Q920N7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Syt12Q920N7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Syt12Q920N7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Syt12Q920N7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Syt12Q920N7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Syt12Q920N7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Syt12Q920N7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Syt12Q920N7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Syt12Q920N7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Syt12Q920N7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Syt12Q920N7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Syt12Q920N7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Syt12Q920N7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Syt12Q920N7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Syt12Q920N7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Syt12Q920N7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Syt12Q920N7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Syt12Q920N7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Syt12Q920N7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Syt12Q920N7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Syt12Q920N7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Syt12Q920N7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Syt12Q920N7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Syt12Q920N7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Syt12Q920N7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Syt12Q920N7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Syt12Q920N7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Syt12Q920N7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Syt12Q920N7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Syt12Q920N7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Syt12Q920N7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Syt12Q920N7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Syt12Q920N7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Syt12Q920N7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Syt12Q920N7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Syt12Q920N7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Syt12Q920N7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Syt12Q920N7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Syt12Q920N7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Syt12Q920N7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Syt12Q920N7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Syt12Q920N7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Syt12Q920N7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Syt12Q920N7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Syt12Q920N7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Syt12Q920N7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Syt12Q920N7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Syt12Q920N7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Syt12Q920N7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Syt12Q920N7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Syt12Q920N7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Syt12Q920N7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Syt12Q920N7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Syt12Q920N7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Syt12Q920N7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Syt12Q920N7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syt12Q920N7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Syt12Q920N7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Syt12Q920N7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syt12Q920N7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Syt12Q920N7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Syt12Q920N7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Syt12Q920N7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syt12Q920N7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Syt12Q920N7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Syt12Q920N7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Syt12Q920N7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms