Protein–RNA interactions for Protein: E9Q046

Tcp10c, T-complex protein 10c, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp10cE9Q046 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Tcp10cE9Q046 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Tcp10cE9Q046 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Tcp10cE9Q046 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Tcp10cE9Q046 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Tcp10cE9Q046 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tcp10cE9Q046 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Tcp10cE9Q046 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tcp10cE9Q046 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tcp10cE9Q046 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Tcp10cE9Q046 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tcp10cE9Q046 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tcp10cE9Q046 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tcp10cE9Q046 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tcp10cE9Q046 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Tcp10cE9Q046 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tcp10cE9Q046 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Tcp10cE9Q046 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tcp10cE9Q046 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tcp10cE9Q046 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tcp10cE9Q046 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tcp10cE9Q046 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Tcp10cE9Q046 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tcp10cE9Q046 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Tcp10cE9Q046 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Tcp10cE9Q046 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Tcp10cE9Q046 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Tcp10cE9Q046 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tcp10cE9Q046 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tcp10cE9Q046 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tcp10cE9Q046 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tcp10cE9Q046 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tcp10cE9Q046 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tcp10cE9Q046 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Tcp10cE9Q046 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tcp10cE9Q046 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tcp10cE9Q046 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tcp10cE9Q046 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tcp10cE9Q046 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tcp10cE9Q046 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tcp10cE9Q046 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tcp10cE9Q046 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Tcp10cE9Q046 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tcp10cE9Q046 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tcp10cE9Q046 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Tcp10cE9Q046 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tcp10cE9Q046 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tcp10cE9Q046 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tcp10cE9Q046 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Tcp10cE9Q046 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Tcp10cE9Q046 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Tcp10cE9Q046 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tcp10cE9Q046 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Tcp10cE9Q046 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tcp10cE9Q046 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tcp10cE9Q046 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Tcp10cE9Q046 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tcp10cE9Q046 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tcp10cE9Q046 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tcp10cE9Q046 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tcp10cE9Q046 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tcp10cE9Q046 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tcp10cE9Q046 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tcp10cE9Q046 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tcp10cE9Q046 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tcp10cE9Q046 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tcp10cE9Q046 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tcp10cE9Q046 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Tcp10cE9Q046 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tcp10cE9Q046 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tcp10cE9Q046 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tcp10cE9Q046 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tcp10cE9Q046 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tcp10cE9Q046 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tcp10cE9Q046 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tcp10cE9Q046 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tcp10cE9Q046 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tcp10cE9Q046 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tcp10cE9Q046 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tcp10cE9Q046 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tcp10cE9Q046 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tcp10cE9Q046 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tcp10cE9Q046 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tcp10cE9Q046 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tcp10cE9Q046 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tcp10cE9Q046 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tcp10cE9Q046 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tcp10cE9Q046 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tcp10cE9Q046 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Tcp10cE9Q046 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tcp10cE9Q046 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tcp10cE9Q046 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tcp10cE9Q046 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tcp10cE9Q046 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tcp10cE9Q046 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tcp10cE9Q046 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tcp10cE9Q046 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Tcp10cE9Q046 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tcp10cE9Q046 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tcp10cE9Q046 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms