Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chrnb2Q9ERK7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Chrnb2Q9ERK7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Chrnb2Q9ERK7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Chrnb2Q9ERK7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Chrnb2Q9ERK7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chrnb2Q9ERK7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chrnb2Q9ERK7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chrnb2Q9ERK7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrnb2Q9ERK7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chrnb2Q9ERK7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chrnb2Q9ERK7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Chrnb2Q9ERK7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chrnb2Q9ERK7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrnb2Q9ERK7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chrnb2Q9ERK7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Chrnb2Q9ERK7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chrnb2Q9ERK7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chrnb2Q9ERK7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chrnb2Q9ERK7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chrnb2Q9ERK7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chrnb2Q9ERK7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chrnb2Q9ERK7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chrnb2Q9ERK7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chrnb2Q9ERK7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chrnb2Q9ERK7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Chrnb2Q9ERK7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chrnb2Q9ERK7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrnb2Q9ERK7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chrnb2Q9ERK7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chrnb2Q9ERK7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrnb2Q9ERK7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrnb2Q9ERK7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrnb2Q9ERK7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chrnb2Q9ERK7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Chrnb2Q9ERK7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chrnb2Q9ERK7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chrnb2Q9ERK7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chrnb2Q9ERK7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chrnb2Q9ERK7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Chrnb2Q9ERK7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Chrnb2Q9ERK7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chrnb2Q9ERK7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chrnb2Q9ERK7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Chrnb2Q9ERK7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chrnb2Q9ERK7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chrnb2Q9ERK7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chrnb2Q9ERK7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chrnb2Q9ERK7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrnb2Q9ERK7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chrnb2Q9ERK7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chrnb2Q9ERK7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrnb2Q9ERK7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Chrnb2Q9ERK7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chrnb2Q9ERK7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrnb2Q9ERK7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chrnb2Q9ERK7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Chrnb2Q9ERK7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chrnb2Q9ERK7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrnb2Q9ERK7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrnb2Q9ERK7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chrnb2Q9ERK7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chrnb2Q9ERK7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrnb2Q9ERK7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chrnb2Q9ERK7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrnb2Q9ERK7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrnb2Q9ERK7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrnb2Q9ERK7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chrnb2Q9ERK7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrnb2Q9ERK7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chrnb2Q9ERK7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrnb2Q9ERK7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrnb2Q9ERK7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrnb2Q9ERK7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrnb2Q9ERK7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrnb2Q9ERK7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrnb2Q9ERK7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrnb2Q9ERK7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrnb2Q9ERK7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chrnb2Q9ERK7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrnb2Q9ERK7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrnb2Q9ERK7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrnb2Q9ERK7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrnb2Q9ERK7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrnb2Q9ERK7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrnb2Q9ERK7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrnb2Q9ERK7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrnb2Q9ERK7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chrnb2Q9ERK7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrnb2Q9ERK7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chrnb2Q9ERK7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms