RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020501.14

Sumo3-201, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sumo3, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Snx21Q3UR97 363 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Scn2bQ56A07 215 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 HltfQ6PCN7 1003 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gpr139Q80UC8 345 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slco6c1Q8C0X7 706 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fem1cQ8CEF1 617 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tspan14Q8QZY6 270 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 BfarQ8R079 450 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Prpsap1Q9D0M1 356 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tchhl1Q9D3P1 638 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccdc97Q9DBT3 340 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cldn3Q9Z0G9 219 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f15A0A087WR44 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f12A0A0A0MQP3 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f9A2BFZ7 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f7A2BHG6 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f19A2CG71 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f10A2CG92 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f3A2CGC2 496 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f13B8JKF6 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Olfr292F8VQ84 308 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f2J3QMS5 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f25J3QMV9 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f6J3QMW9 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f26J3QNK2 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f8J3QQ50 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Vmn2r10K7N621 847 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f17L7MU81 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f18L7MU83 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cdh1P09803 884 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ctla2bP12400 113 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 MutP16332 748 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Htr7P32304 448 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 St14P56677 855 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fitm2P59266 262 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gabrb3P63080 473 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ldb1P70662 411 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PgrQ00175 926 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mdga1Q0PMG2 940 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fam47cQ14BE7 430 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Btbd35f27Q5FWA1 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sdf4Q61112 361 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Sel1l3Q80TS8 1137 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mapkap1Q8BKH7 522 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zfp398Q8BV16 643 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 TbcdQ8BYA0 1196 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nkiras1Q8CEC5 192 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mill2Q8HWE5 355 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Olfr846Q8VET8 312 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 HnmtQ91VF2 295 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 GMCL1P1Q99N64 498 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Apobec2Q9WV35 224 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gria4Q9Z2W8 902 aa14.62□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Col12a1Q60847 3120 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Grin3aA2AIR5 1135 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zscan4bE9Q3G0 505 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Bcl6P41183 707 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Tmem207P86045 143 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 MslnQ61468 625 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Itih1Q61702 907 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Nfe2l1Q61985 741 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Taf1cQ6PDZ2 836 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Clptm1lQ8BXA5 539 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Wdr74Q8VCG3 384 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Macrod1Q922B1 323 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dhrs7bQ99J47 323 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ska2Q9CR46 120 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 4930524N10RikQ9D519 233 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cdyl2Q9D5D8 503 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pias4Q9JM05 507 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 B9d1Q9R1S0 204 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 DmdP11531 3678 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Olfr742A2RTP5 311 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Phf11A6H5X4 337 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Adamts14E9PX39 1209 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cyp4f17G3UW78 524 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Gm2888K7N746 267 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 CenpaO35216 134 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Grk4O70291 574 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccl4P14097 92 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 HdxQ14B70 692 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Them6Q80ZW2 207 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Susd6Q8BGE4 302 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Slc30a5Q8R4H9 761 aa14.61□□□□□ -0.07
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mtfr2Q8VED8 361 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.3 ms