Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Cldn3Q9Z0G9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cldn3Q9Z0G9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cldn3Q9Z0G9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cldn3Q9Z0G9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cldn3Q9Z0G9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cldn3Q9Z0G9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cldn3Q9Z0G9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Cldn3Q9Z0G9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cldn3Q9Z0G9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cldn3Q9Z0G9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cldn3Q9Z0G9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Cldn3Q9Z0G9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Cldn3Q9Z0G9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cldn3Q9Z0G9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cldn3Q9Z0G9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Cldn3Q9Z0G9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cldn3Q9Z0G9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cldn3Q9Z0G9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cldn3Q9Z0G9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cldn3Q9Z0G9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cldn3Q9Z0G9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cldn3Q9Z0G9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cldn3Q9Z0G9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cldn3Q9Z0G9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cldn3Q9Z0G9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cldn3Q9Z0G9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cldn3Q9Z0G9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cldn3Q9Z0G9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cldn3Q9Z0G9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cldn3Q9Z0G9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cldn3Q9Z0G9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cldn3Q9Z0G9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cldn3Q9Z0G9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cldn3Q9Z0G9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cldn3Q9Z0G9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cldn3Q9Z0G9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cldn3Q9Z0G9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cldn3Q9Z0G9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cldn3Q9Z0G9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cldn3Q9Z0G9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cldn3Q9Z0G9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cldn3Q9Z0G9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cldn3Q9Z0G9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cldn3Q9Z0G9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cldn3Q9Z0G9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cldn3Q9Z0G9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cldn3Q9Z0G9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cldn3Q9Z0G9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cldn3Q9Z0G9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cldn3Q9Z0G9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cldn3Q9Z0G9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cldn3Q9Z0G9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cldn3Q9Z0G9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cldn3Q9Z0G9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cldn3Q9Z0G9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cldn3Q9Z0G9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cldn3Q9Z0G9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cldn3Q9Z0G9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cldn3Q9Z0G9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cldn3Q9Z0G9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cldn3Q9Z0G9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cldn3Q9Z0G9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cldn3Q9Z0G9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cldn3Q9Z0G9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cldn3Q9Z0G9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cldn3Q9Z0G9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cldn3Q9Z0G9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cldn3Q9Z0G9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cldn3Q9Z0G9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cldn3Q9Z0G9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cldn3Q9Z0G9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cldn3Q9Z0G9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cldn3Q9Z0G9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cldn3Q9Z0G9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cldn3Q9Z0G9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cldn3Q9Z0G9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cldn3Q9Z0G9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cldn3Q9Z0G9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cldn3Q9Z0G9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cldn3Q9Z0G9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cldn3Q9Z0G9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cldn3Q9Z0G9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cldn3Q9Z0G9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cldn3Q9Z0G9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cldn3Q9Z0G9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cldn3Q9Z0G9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cldn3Q9Z0G9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cldn3Q9Z0G9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cldn3Q9Z0G9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cldn3Q9Z0G9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cldn3Q9Z0G9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cldn3Q9Z0G9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms