Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Tchhl1Q9D3P1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tchhl1Q9D3P1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tchhl1Q9D3P1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tchhl1Q9D3P1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tchhl1Q9D3P1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Tchhl1Q9D3P1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tchhl1Q9D3P1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Tchhl1Q9D3P1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Tchhl1Q9D3P1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tchhl1Q9D3P1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tchhl1Q9D3P1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tchhl1Q9D3P1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Tchhl1Q9D3P1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Tchhl1Q9D3P1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Tchhl1Q9D3P1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tchhl1Q9D3P1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tchhl1Q9D3P1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tchhl1Q9D3P1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tchhl1Q9D3P1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tchhl1Q9D3P1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tchhl1Q9D3P1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tchhl1Q9D3P1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tchhl1Q9D3P1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tchhl1Q9D3P1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tchhl1Q9D3P1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Tchhl1Q9D3P1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tchhl1Q9D3P1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tchhl1Q9D3P1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tchhl1Q9D3P1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tchhl1Q9D3P1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Tchhl1Q9D3P1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tchhl1Q9D3P1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tchhl1Q9D3P1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tchhl1Q9D3P1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tchhl1Q9D3P1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tchhl1Q9D3P1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tchhl1Q9D3P1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tchhl1Q9D3P1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tchhl1Q9D3P1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tchhl1Q9D3P1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tchhl1Q9D3P1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tchhl1Q9D3P1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tchhl1Q9D3P1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tchhl1Q9D3P1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tchhl1Q9D3P1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tchhl1Q9D3P1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tchhl1Q9D3P1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tchhl1Q9D3P1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tchhl1Q9D3P1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tchhl1Q9D3P1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tchhl1Q9D3P1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tchhl1Q9D3P1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tchhl1Q9D3P1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tchhl1Q9D3P1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tchhl1Q9D3P1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tchhl1Q9D3P1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tchhl1Q9D3P1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tchhl1Q9D3P1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tchhl1Q9D3P1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tchhl1Q9D3P1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tchhl1Q9D3P1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tchhl1Q9D3P1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tchhl1Q9D3P1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tchhl1Q9D3P1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tchhl1Q9D3P1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tchhl1Q9D3P1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tchhl1Q9D3P1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tchhl1Q9D3P1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Tchhl1Q9D3P1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tchhl1Q9D3P1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tchhl1Q9D3P1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tchhl1Q9D3P1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tchhl1Q9D3P1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tchhl1Q9D3P1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tchhl1Q9D3P1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tchhl1Q9D3P1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tchhl1Q9D3P1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tchhl1Q9D3P1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tchhl1Q9D3P1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tchhl1Q9D3P1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tchhl1Q9D3P1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tchhl1Q9D3P1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tchhl1Q9D3P1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tchhl1Q9D3P1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tchhl1Q9D3P1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tchhl1Q9D3P1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tchhl1Q9D3P1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tchhl1Q9D3P1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tchhl1Q9D3P1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tchhl1Q9D3P1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tchhl1Q9D3P1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tchhl1Q9D3P1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tchhl1Q9D3P1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tchhl1Q9D3P1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tchhl1Q9D3P1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tchhl1Q9D3P1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tchhl1Q9D3P1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tchhl1Q9D3P1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tchhl1Q9D3P1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms