Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Nfe2l1Q61985 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nfe2l1Q61985 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nfe2l1Q61985 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nfe2l1Q61985 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nfe2l1Q61985 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nfe2l1Q61985 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Nfe2l1Q61985 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Nfe2l1Q61985 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Nfe2l1Q61985 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nfe2l1Q61985 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nfe2l1Q61985 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Nfe2l1Q61985 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Nfe2l1Q61985 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nfe2l1Q61985 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nfe2l1Q61985 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nfe2l1Q61985 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Nfe2l1Q61985 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nfe2l1Q61985 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nfe2l1Q61985 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nfe2l1Q61985 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nfe2l1Q61985 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nfe2l1Q61985 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nfe2l1Q61985 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nfe2l1Q61985 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nfe2l1Q61985 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nfe2l1Q61985 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Nfe2l1Q61985 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nfe2l1Q61985 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nfe2l1Q61985 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nfe2l1Q61985 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nfe2l1Q61985 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Nfe2l1Q61985 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nfe2l1Q61985 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nfe2l1Q61985 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nfe2l1Q61985 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nfe2l1Q61985 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nfe2l1Q61985 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nfe2l1Q61985 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nfe2l1Q61985 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nfe2l1Q61985 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nfe2l1Q61985 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nfe2l1Q61985 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nfe2l1Q61985 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nfe2l1Q61985 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nfe2l1Q61985 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nfe2l1Q61985 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nfe2l1Q61985 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nfe2l1Q61985 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Nfe2l1Q61985 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nfe2l1Q61985 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nfe2l1Q61985 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nfe2l1Q61985 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nfe2l1Q61985 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nfe2l1Q61985 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nfe2l1Q61985 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nfe2l1Q61985 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nfe2l1Q61985 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nfe2l1Q61985 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l1Q61985 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nfe2l1Q61985 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nfe2l1Q61985 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nfe2l1Q61985 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nfe2l1Q61985 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nfe2l1Q61985 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nfe2l1Q61985 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Nfe2l1Q61985 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nfe2l1Q61985 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nfe2l1Q61985 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nfe2l1Q61985 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nfe2l1Q61985 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nfe2l1Q61985 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nfe2l1Q61985 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nfe2l1Q61985 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nfe2l1Q61985 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nfe2l1Q61985 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nfe2l1Q61985 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nfe2l1Q61985 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nfe2l1Q61985 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nfe2l1Q61985 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nfe2l1Q61985 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nfe2l1Q61985 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nfe2l1Q61985 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nfe2l1Q61985 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfe2l1Q61985 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nfe2l1Q61985 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nfe2l1Q61985 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nfe2l1Q61985 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nfe2l1Q61985 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nfe2l1Q61985 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nfe2l1Q61985 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nfe2l1Q61985 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nfe2l1Q61985 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nfe2l1Q61985 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nfe2l1Q61985 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nfe2l1Q61985 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nfe2l1Q61985 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nfe2l1Q61985 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nfe2l1Q61985 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nfe2l1Q61985 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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