Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Ctla2bP12400 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ctla2bP12400 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ctla2bP12400 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ctla2bP12400 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Ctla2bP12400 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ctla2bP12400 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ctla2bP12400 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ctla2bP12400 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ctla2bP12400 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ctla2bP12400 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ctla2bP12400 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Ctla2bP12400 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ctla2bP12400 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ctla2bP12400 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ctla2bP12400 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Ctla2bP12400 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ctla2bP12400 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Ctla2bP12400 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ctla2bP12400 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ctla2bP12400 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ctla2bP12400 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ctla2bP12400 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ctla2bP12400 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ctla2bP12400 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ctla2bP12400 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ctla2bP12400 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ctla2bP12400 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ctla2bP12400 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ctla2bP12400 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ctla2bP12400 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ctla2bP12400 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ctla2bP12400 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ctla2bP12400 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ctla2bP12400 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ctla2bP12400 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ctla2bP12400 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ctla2bP12400 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ctla2bP12400 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ctla2bP12400 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ctla2bP12400 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ctla2bP12400 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ctla2bP12400 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ctla2bP12400 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ctla2bP12400 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ctla2bP12400 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ctla2bP12400 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ctla2bP12400 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ctla2bP12400 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ctla2bP12400 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ctla2bP12400 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ctla2bP12400 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctla2bP12400 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ctla2bP12400 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ctla2bP12400 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ctla2bP12400 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ctla2bP12400 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ctla2bP12400 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ctla2bP12400 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ctla2bP12400 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctla2bP12400 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctla2bP12400 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ctla2bP12400 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctla2bP12400 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctla2bP12400 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctla2bP12400 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ctla2bP12400 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ctla2bP12400 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ctla2bP12400 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ctla2bP12400 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ctla2bP12400 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctla2bP12400 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctla2bP12400 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ctla2bP12400 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ctla2bP12400 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ctla2bP12400 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctla2bP12400 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctla2bP12400 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ctla2bP12400 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ctla2bP12400 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctla2bP12400 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctla2bP12400 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctla2bP12400 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ctla2bP12400 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ctla2bP12400 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ctla2bP12400 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctla2bP12400 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctla2bP12400 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ctla2bP12400 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctla2bP12400 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctla2bP12400 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ctla2bP12400 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctla2bP12400 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ctla2bP12400 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctla2bP12400 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctla2bP12400 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctla2bP12400 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctla2bP12400 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctla2bP12400 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ctla2bP12400 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms