RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020501.14

Sumo3-201, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sumo3, Length 2,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-201ENSMUST00000020501 NischQ80TM9 1593 aa30.65■■■□□ 2.5
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Abcc8B2RUS7 1588 aa29.38■■■□□ 2.29
Sumo3-201ENSMUST00000020501 ScribQ80U72 1612 aa27.9■■■□□ 2.06
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.46■■□□□ 1.99
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kdm5dQ62240 1548 aa27.15■■□□□ 1.94
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dcaf1Q80TR8 1506 aa27.12■■□□□ 1.93
Sumo3-201ENSMUST00000020501 NacadQ5SWP3 1504 aa27■■□□□ 1.91
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa26.78■■□□□ 1.88
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Baz1aO88379 1555 aa26.42■■□□□ 1.82
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Crybg2B7ZCC2 1516 aa26.05■■□□□ 1.76
Sumo3-201ENSMUST00000020501 BicraF8VPZ9 1578 aa26.05■■□□□ 1.76
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa24.82■■□□□ 1.56
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Golga3P55937 1487 aa24.5■■□□□ 1.51
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Top2bQ64511 1612 aa24.37■■□□□ 1.49
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.32■■□□□ 1.48
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Unc13aQ4KUS2 1712 aa24.28■■□□□ 1.48
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.26■■□□□ 1.47
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.22■■□□□ 1.47
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.16■■□□□ 1.46
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cep164Q5DU05 1446 aa24.02■■□□□ 1.44
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Fmn1Q05860 1466 aa24.02■■□□□ 1.44
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.99■■□□□ 1.43
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.97■■□□□ 1.43
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lamc3Q9R0B6 1581 aa23.96■■□□□ 1.43
Sumo3-201ENSMUST00000020501 TnnQ80Z71 1560 aa23.94■■□□□ 1.42
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mrc2Q64449 1479 aa23.59■■□□□ 1.37
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ccdc18Q640L5 1455 aa23.59■■□□□ 1.37
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PtprkP35822 1457 aa23.44■■□□□ 1.34
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Grin2bQ01097 1482 aa23.44■■□□□ 1.34
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa23.42■■□□□ 1.34
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Kif21aQ9QXL2 1672 aa23.4■■□□□ 1.34
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Npm2Q80W85 207 aa23.34■■□□□ 1.33
Sumo3-201ENSMUST00000020501 NrkQ9R0G8 1455 aa23.33■■□□□ 1.32
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Sumo3-201ENSMUST00000020501 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Shroom4Q1W617 1475 aa23.3■■□□□ 1.32
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Cep162Q6ZQ06 1403 aa23.27■■□□□ 1.32
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Myt1lP97500 1187 aa23.18■■□□□ 1.3
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Efcab5A0JP43 1406 aa23.17■■□□□ 1.3
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Crocc2F6XLV1 1638 aa23.17■■□□□ 1.3
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Arhgap35Q91YM2 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Samd9lQ69Z37 1561 aa23.13■■□□□ 1.29
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Plb1Q3TTY0 1478 aa23.1■■□□□ 1.29
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Zeb1Q64318 1117 aa23.09■■□□□ 1.29
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa23.07■■□□□ 1.28
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa23.05■■□□□ 1.28
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.03■■□□□ 1.28
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Rad54l2Q99NG0 1466 aa23.01■■□□□ 1.27
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.89■■□□□ 1.26
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Clip1Q922J3 1391 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.85■■□□□ 1.25
Sumo3-201ENSMUST00000020501 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Ift140E9PY46 1464 aa22.81■■□□□ 1.24
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Pla2r1Q62028 1487 aa22.81■■□□□ 1.24
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Sumo3-201ENSMUST00000020501 Grin2aP35436 1464 aa22.8■■□□□ 1.24
Sumo3-201ENSMUST00000020501 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.8■■□□□ 1.24
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