Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Snx21Q3UR97 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Snx21Q3UR97 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Snx21Q3UR97 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Snx21Q3UR97 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Snx21Q3UR97 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Snx21Q3UR97 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Snx21Q3UR97 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Snx21Q3UR97 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Snx21Q3UR97 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Snx21Q3UR97 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Snx21Q3UR97 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Snx21Q3UR97 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Snx21Q3UR97 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Snx21Q3UR97 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Snx21Q3UR97 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Snx21Q3UR97 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Snx21Q3UR97 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Snx21Q3UR97 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Snx21Q3UR97 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Snx21Q3UR97 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Snx21Q3UR97 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Snx21Q3UR97 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Snx21Q3UR97 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snx21Q3UR97 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Snx21Q3UR97 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Snx21Q3UR97 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Snx21Q3UR97 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Snx21Q3UR97 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Snx21Q3UR97 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Snx21Q3UR97 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Snx21Q3UR97 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Snx21Q3UR97 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Snx21Q3UR97 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Snx21Q3UR97 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snx21Q3UR97 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snx21Q3UR97 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snx21Q3UR97 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx21Q3UR97 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snx21Q3UR97 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snx21Q3UR97 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx21Q3UR97 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx21Q3UR97 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snx21Q3UR97 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snx21Q3UR97 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snx21Q3UR97 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Snx21Q3UR97 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Snx21Q3UR97 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snx21Q3UR97 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snx21Q3UR97 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snx21Q3UR97 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snx21Q3UR97 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx21Q3UR97 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snx21Q3UR97 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx21Q3UR97 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Snx21Q3UR97 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snx21Q3UR97 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snx21Q3UR97 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Snx21Q3UR97 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Snx21Q3UR97 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snx21Q3UR97 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snx21Q3UR97 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx21Q3UR97 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx21Q3UR97 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snx21Q3UR97 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx21Q3UR97 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx21Q3UR97 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snx21Q3UR97 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snx21Q3UR97 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx21Q3UR97 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx21Q3UR97 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx21Q3UR97 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx21Q3UR97 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx21Q3UR97 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx21Q3UR97 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx21Q3UR97 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx21Q3UR97 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx21Q3UR97 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx21Q3UR97 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Snx21Q3UR97 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx21Q3UR97 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Snx21Q3UR97 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx21Q3UR97 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx21Q3UR97 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx21Q3UR97 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snx21Q3UR97 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx21Q3UR97 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx21Q3UR97 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx21Q3UR97 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx21Q3UR97 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx21Q3UR97 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx21Q3UR97 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snx21Q3UR97 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx21Q3UR97 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx21Q3UR97 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx21Q3UR97 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx21Q3UR97 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx21Q3UR97 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx21Q3UR97 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx21Q3UR97 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms