RNA–Protein interactions for RNA: YOR079C

ATX2, Transcript of Golgi membrane protein involved in manganese homeostasis, yeast

Gene ATX2, Length 942 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATX2	YOR079C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	SEC20	P28791	383 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	PRO1	P32264	428 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	SQT1	P35184	431 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	FAA3	P39002	694 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATX2	YOR079C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	RDH54	P38086	958 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	PTC7	P38797	343 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	ORC3	P54790	616 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	ADI1	Q03677	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	TAF7	Q05021	590 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
ATX2	YOR079C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	YNR063W	P53749	607 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	HSE1	P38753	452 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	NIT1	P40447	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	GTS1	P40956	396 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	LAP2	Q10740	671 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	SAM35	P14693	329 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	ADD66	P36040	267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	UBP5	P39944	805 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	PIC2	P40035	300 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	ATG14	P38270	344 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	YHL012W	P38709	493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	RKM2	Q03942	479 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	CDA2	Q06703	312 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	YJL045W	P47052	634 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATX2	YOR079C	AFG2	P32794	780 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	YGR122W	P53272	402 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	EST2	Q06163	884 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	YDL177C	Q12257	170 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	MDL2	P33311	773 aa		5	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	SLD2	P34252	453 aa		5	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	VPS53	P47061	822 aa		5	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	MRPS18	P42847	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	MCD1	Q12158	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	KIP1	P28742	1111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	YSC84	P32793	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	HDA2	Q06629	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	RAD2	P07276	1031 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	TAF13	P11747	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	CYC8	P14922	966 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	ATE1	P16639	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	AIM26	P32858	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	THI80	P35202	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	ALG3	P38179	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	POL32	P47110	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	MRPL22	P53881	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	PTC5	Q12511	572 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATX2	YOR079C	MCM2	P29469	868 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	GPB2	P39717	880 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
ATX2	YOR079C	ROD1	Q02805	837 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	YML020W	Q03722	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	RSC58	Q07979	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	MGE1	P38523	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	YJR107W	P47145	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	GNP1	P48813	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	HXT13	P39924	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	HXT17	P53631	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	SIW14	P53965	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	HXT15	P54854	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	COQ4	O13525	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	MKK2	P32491	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	BAP2	P38084	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	FYV10	P40492	516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	TNA1	P53322	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	SPR28	Q04921	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	ESC8	Q08119	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	GCR1	P07261	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	SPS1	P08458	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATX2	YOR079C	SNF5	P18480	905 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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