RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR078W	YKR078W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	ADP1	P25371	1049 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	HSP78	P33416	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	SEG2	P34250	1132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	RDH54	P38086	958 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	AOS1	Q06624	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	DFG16	Q99234	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	TPP1	Q03796	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	ECL1	P48235	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
YKR078W	YKR078W	RNQ1	P25367	405 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	PRO1	P32264	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	PIC2	P40035	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	YNR063W	P53749	607 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	ORC3	P54790	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	LAP2	Q10740	671 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	SLD2	P34252	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	ADD66	P36040	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	HSE1	P38753	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	PTC7	P38797	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	ATG14	P38270	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	GTS1	P40956	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	RKM2	Q03942	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YKR078W	YKR078W	SAM35	P14693	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	EST2	Q06163	884 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	UBP5	P39944	805 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	YGR122W	P53272	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	AFG2	P32794	780 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	YHL012W	P38709	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	NIT1	P40447	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	MRPS18	P42847	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	YJL045W	P47052	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	VPS53	P47061	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	YML020W	Q03722	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	MCD1	Q12158	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	ATE1	P16639	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	MDL2	P33311	773 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	RAD2	P07276	1031 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	CYC8	P14922	966 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	MCM2	P29469	868 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	POL32	P47110	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	CDA2	Q06703	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	YSC84	P32793	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	HDA2	Q06629	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	TAF13	P11747	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	KIP1	P28742	1111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	MGE1	P38523	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR078W	YKR078W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	PTC5	Q12511	572 aa		4.53	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	ALG3	P38179	458 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	YJR107W	P47145	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	ROD1	Q02805	837 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	HEM3	P28789	327 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	AIM26	P32858	118 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	GPB2	P39717	880 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	RSC58	Q07979	502 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	SEC8	P32855	1065 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	THI80	P35202	319 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	HXT13	P39924	564 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	GNP1	P48813	663 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	HXT17	P53631	564 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	MRPL22	P53881	309 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	SIW14	P53965	281 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	HXT15	P54854	567 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
YKR078W	YKR078W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	SPR28	Q04921	423 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	GCR1	P07261	785 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	FYV10	P40492	516 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	MKK2	P32491	506 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	BAP2	P38084	609 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	ENT3	P47160	408 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	TNA1	P53322	534 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	MRL1	Q06815	381 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	COQ4	O13525	335 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR078W	YKR078W	SNF5	P18480	905 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms