RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data5.78□□□□□ -1.48not detected
RRN3YKL125W MSM1P22438 575 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W RPN2P32565 945 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W TFC3P34111 1160 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W MET18P40469 1032 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W GCN20P43535 752 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W MRX12P47084 519 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W ILM1P47155 203 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W YGL242CP53066 181 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W SHE10P53075 577 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W YML108WQ03759 105 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3YKL125W PET494P07390 489 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W NAT1P12945 854 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W ATO2P32907 282 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W RIB7P33312 244 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W COY1P34237 679 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YSW1P38280 609 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W HSM3P38348 480 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W CIC1P38779 376 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W GGA2P38817 585 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W STB1P42845 420 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W OSW7P43611 510 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W SDA1P53313 767 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W ESBP6P53918 673 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YNL115CP53925 644 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W RCM1P53972 490 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W GCR2Q01722 534 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YML083CQ04526 418 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YPR097WQ06839 1073 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W PCL8Q08966 492 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W GNT1Q12096 491 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W CDC25P04821 1589 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W STE6P12866 1290 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W HCS1P34243 683 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W SAK1P38990 1142 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W HXT13P39924 564 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W RBL2P48606 106 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YDL073WQ07454 984 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YOR296WQ08748 1289 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W MCM16Q12262 181 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W RKM4Q12504 494 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TRS33Q99394 268 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W SWI1P09547 1314 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-FP0CX63 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-CP25384 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-DR2Q03494 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY1B-DR1Q03855 1755 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-OR1Q12113 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-DR1Q12472 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-BQ12491 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY2B-OR2Q12501 1770 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY1B-DR3Q99231 1755 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W CMP2P14747 604 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W ARG1P22768 420 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W MBR1P23493 339 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W PAP1P29468 568 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W UBP12P39538 1254 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data5.76□□□□□ -1.49not detected
RRN3YKL125W RBA50Q04418 439 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W FUS2Q05670 677 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W AVO1Q08236 1176 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W MPC54Q08550 464 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YRR1Q12172 810 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W RPC19P28000 142 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W NUP120P35729 1037 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W PCH2P38126 564 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W APD1P38281 316 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W VID27P40157 782 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YIL001WP40560 513 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W RTS3P53289 263 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W FAR11P53917 953 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TAF8Q03750 510 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YLR177WQ06251 628 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W HMI1Q12039 706 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W LYS2P07702 1392 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W HIS3P06633 220 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TRM1P15565 570 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W FRS2P15625 503 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TGL4P36165 910 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W CCT4P39078 528 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W ATG3P40344 310 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W CCT5P40413 562 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W TY4A-JP47023 414 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W YJR079WP47126 109 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3YKL125W PRP43P53131 767 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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