RNA–Protein interactions for RNA: YGL163C

RAD54, Transcript of DNA-dependent ATPase that stimulates strand exchange, yeast

Gene RAD54, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD54	YGL163C	YNL034W	P53963	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YNL018C	P53976	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TGL2	P54857	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	THI73	Q07904	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YRR1	Q12172	810 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CCP1	P00431	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CDC34	P14682	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	ACE2	P21192	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	PTP2	P29461	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	ESL1	P40456	1118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	SUM1	P46676	1062 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MAK10	Q02197	733 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	ESC2	Q06340	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CSC1	Q06538	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	PSR1	Q07800	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	NPR1	P22211	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	AAD3	P25612	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TPD3	P31383	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	NUP120	P35729	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MXR1	P40029	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MRPS18	P42847	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YNR063W	P53749	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YNL058C	P53947	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	UGO1	Q03327	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MED1	Q12321	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	GAL1	P04385	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	SOH1	P38633	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	EUG1	P32474	517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YKL069W	P36088	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YHR218W	P38899	603 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
RAD54	YGL163C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	BDS1	Q08347	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MCM10	P32354	571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YBR184W	P38299	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	HUL4	P40985	892 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	BAS1	P22035	811 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	ARE1	P25628	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TFC4	P33339	1025 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	IML2	P47031	731 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YJR115W	P47152	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YGR053C	P53234	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MDM38	Q08179	573 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	PLC1	P32383	869 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	TBS1	P38114	1094 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	POP2	P39008	433 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	CNN1	P43618	361 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	YNL193W	P53870	558 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	MCD1	Q12158	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	SAC3	P46674	1301 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	MCM1	P11746	286 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	NIC96	P34077	839 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	YKL133C	P36066	463 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	STR2	P47164	639 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	ERP6	P53198	216 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	YNL011C	P53980	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	HFD1	Q04458	532 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	SSP2	Q08646	371 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	PDR11	P40550	1411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	KIP2	P28743	706 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	DBF20	P32328	564 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	FAA3	P39002	694 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	BNA1	P47096	177 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RAD54	YGL163C	PUS6	P53294	404 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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