RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YML131W	Q03102	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	GIC2	Q06648	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TFC4	P33339	1025 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	BAP2	P38084	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PTC4	P38089	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	RAD55	P38953	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	GNP1	P48813	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	HFD1	Q04458	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MRL1	Q06815	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	RIM4	P38741	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MDM12	Q92328	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MEF1	P25039	761 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MKK2	P32491	506 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	NTA1	P40354	457 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SEC2	P17065	759 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
SYF1	YDR416W	VMA3	P25515	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MGS1	P40151	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MNT3	P40549	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	ISM1	P48526	1002 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	UBA2	P52488	636 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	REH1	Q06709	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	NIC96	P34077	839 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	GTT3	P39996	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	ALR2	P43553	858 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	RGD2	P43556	714 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	KXD1	P53158	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SPC19	Q03954	165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	DBF20	P32328	564 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	IMP2'	P32351	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SCD5	P34758	872 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TGL3	P40308	642 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	ESL1	P40456	1118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	HXT10	P43581	546 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MLC2	Q06580	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PAN1	P32521	1480 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SPS1	P08458	490 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	YHL041W	P38730	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PSY2	P40164	858 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SAP185	P40856	1058 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	XKS1	P42826	600 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SSP2	Q08646	371 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MED1	Q12321	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	YKL133C	P36066	463 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	RKM3	P38222	552 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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