RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637140.1

ATP6AP2-222, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 2, human

TSL 2

Gene ATP6AP2, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RAB15	P59190	212 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ARHGEF15	O94989	841 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FOXK2	Q01167	660 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SLC35F4	A4IF30	521 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPINT1	O43278	529 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LILRA1	O75019	489 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CDC14C	A4D256	554 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RNF20	Q5VTR2	975 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADH1A	P07327	375 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ITGA6	P23229	1130 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RELB	Q01201	579 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	IRF5	Q13568	498 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MCM6	Q14566	821 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	XP32	Q5T750	250 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CYLD	Q9NQC7	956 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PTGIR	P43119	386 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SCRIB	Q14160	1630 aa		7.46	□□□□□ -1.21
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ABL2	P42684	1182 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ERVK-9	P63128	1117 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	7.46	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MAP3K10	Q02779	954 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADAM23	O75077	832 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	VAC14	Q08AM6	782 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WASHC4	Q2M389	1173 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ERCC6	Q03468	1493 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MSTN	O14793	375 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SCTR	P47872	440 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RNF217	Q8TC41	542 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TRAK2	O60296	914 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140		A0A1W2PRU2	124 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FLII	Q13045	1269 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DCAF5	Q96JK2	942 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MEN1	O00255	615 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GPC1	P35052	558 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RNF135	Q8IUD6	432 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SOX11	P35716	441 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CLN3	Q13286	438 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GAS6	Q14393	721 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	POM121	Q96HA1	1249 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NES	P48681	1621 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GNRH1	P01148	92 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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