RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPL4-208	ENST00000564744	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPL4-208	ENST00000564744	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RPL4-208	ENST00000564744	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	DDB1	Q16531	1140 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	EXOC5	O00471	708 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.36	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	PRKAR2B	P31323	418 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	MIER1	Q8N108	512 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	KDR	P35968	1356 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	ITGB4	P16144	1822 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RPL4-208	ENST00000564744	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	BTAF1	O14981	1849 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	CYP27B1	O15528	508 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	FCHSD2	O94868	740 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PHKG2	P15735	406 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	TRIM37	O94972	964 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RPL4-208	ENST00000564744	KCNQ2	O43526	872 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	NEFM	P07197	916 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61	9e-69	■□□□□ 11.2
RPL4-208	ENST00000564744	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	CCER2	I3L3R5	266 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	NFE2L2	Q16236	605 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	EP400	Q96L91	3159 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	APAF1	O14727	1248 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	MCM10	Q7L590	875 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	BCL9	O00512	1426 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	APBA3	O96018	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	RIPK4	P57078	832 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	CABP4	P57796	275 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPL4-208	ENST00000564744	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.22	□□□□□ -0.61

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