RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 PPP4CP60510 307 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 SULF1Q8IWU6 871 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 NWD1Q149M9 1564 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 STRCQ7RTU9 1775 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 TRIM52Q96A61 297 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.94□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 PIK3C2GO75747 1445 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 SLC10A3P09131 477 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 MS4A1P11836 297 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 ILDR2Q71H61 639 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 MED14O60244 1454 aa5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 CFHP08603 1231 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 NECTIN2Q92692 538 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 WBP1LQ9NX94 342 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 ADGRB1O14514 1584 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 TMEM2Q9UHN6 1383 aa5.92□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 RIMS2Q9UQ26 1411 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 CPS1P31327 1500 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 SOCS7O14512 581 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 CD46P15529 392 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 KMT5BQ4FZB7 885 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 SLC52A1Q9NWF4 448 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 LTBP4Q8N2S1 1624 aa5.91□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.9□□□□□ -1.46
CTPS1-212ENST00000498694 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa5.9□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa5.9□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ALKQ9UM73 1620 aa5.89□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 GCGRP47871 477 aa5.89□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 IDI1Q13907 227 aa5.89□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.89□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 FAM117AQ9C073 453 aa5.89□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 HCSTQ9UBK5 93 aa5.89□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 APLP1P51693 650 aa5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 IL27Q8NEV9 243 aa5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PRR14Q9BWN1 585 aa5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 TECPR2O15040 1411 aa5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 STRCP1A6NGW2 1772 aa5.88□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 KDM4AO75164 1064 aa5.87□□□□□ -1.47
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CTPS1-212ENST00000498694 TONSLQ96HA7 1378 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PTCH1Q13635 1447 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 DLC1Q96QB1 1528 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ADGRB2O60241 1585 aa5.87□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 FUT2Q10981 343 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 COPS2P61201 443 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 QRICH2Q9H0J4 1663 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PTPRUQ92729 1446 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 PIK3R4Q99570 1358 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ATP6V1AP38606 617 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 USP46P62068 366 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 DIXDC1Q155Q3 683 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-212ENST00000498694 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa5.84□□□□□ -1.48
CTPS1-212ENST00000498694 MOXD2PA6NHM9 499 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-212ENST00000498694 HOXA2O43364 376 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-212ENST00000498694 NDUFV2P19404 249 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-212ENST00000498694 LTKP29376 864 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-212ENST00000498694 GUCA2AQ02747 115 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-212ENST00000498694 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-212ENST00000498694 HLA-CQ95604 372 aa5.83□□□□□ -1.48
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