RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 USP31Q70CQ4 1352 aa6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 GCP02774 474 aa6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 BARGINQ6ZT62 677 aa6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 FAM122AQ96E09 287 aa6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 CABP1Q9NZU7 370 aa6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 VCANP13611 3396 aa6.23□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 ABTB2Q8N961 1025 aa6.22□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.22□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 BCL9O00512 1426 aa6.22□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.22□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 TTC21AQ8NDW8 1320 aa6.22□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 LTN1O94822 1766 aa6.21□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 RGPD5Q99666 1765 aa6.21□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 A0A1W2PP64 1363 aa6.21□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 TONSLQ96HA7 1378 aa6.21□□□□□ -1.41
PHF20-212ENST00000485604 SBF2Q86WG5 1849 aa6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 PLSCR1O15162 318 aa6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 NEUROD1Q13562 356 aa6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 NLRP13Q86W25 1043 aa6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 TESK2Q96S53 571 aa6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 PIEZO1Q92508 2521 aa6.21□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 SLC15A2Q16348 729 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 NBPF15Q8N660 670 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 STRN4Q9NRL3 753 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.2□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 PAPPAQ13219 1627 aa6.19□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 NLRP6P59044 892 aa6.19□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.19□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 NHSQ6T4R5 1651 aa6.19□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 SOX10P56693 466 aa6.18□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 PROM2Q8N271 834 aa6.18□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 STK32BQ9NY57 414 aa6.18□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.18□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 ERBB3P21860 1342 aa6.18□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 USP47Q96K76 1375 aa6.18□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 NME9Q86XW9 330 aa6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 USP35Q9P2H5 1018 aa6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 CCDC7Q96M83 1385 aa6.17□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.16□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.16□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.16□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.16□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 RTL1A6NKG5 1358 aa6.16□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 POLD1P28340 1107 aa6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 EVA1CP58658 441 aa6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 CREBZFQ9NS37 354 aa6.15□□□□□ -1.42
PHF20-212ENST00000485604 NCAPD2Q15021 1401 aa6.15□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 BTAF1O14981 1849 aa6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 PDE3BQ13370 1112 aa6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 CNTNAP1P78357 1384 aa6.14□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.13□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 DDB1Q16531 1140 aa6.13□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.13□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.13□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.13□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.12□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 SOX12O15370 315 aa6.12□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 NSD2O96028 1365 aa6.12□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 VEGFBP49765 207 aa6.12□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.12□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.12□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.12□□□□□ -1.43
PHF20-212ENST00000485604 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms