RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480099.1

PKDCC-206, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 787 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-206ENST00000480099 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
PKDCC-206ENST00000480099 DDB1Q16531 1140 aa21.66■■□□□ 1.06
PKDCC-206ENST00000480099 TNS2Q63HR2 1409 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-206ENST00000480099 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.65■■□□□ 1.06
PKDCC-206ENST00000480099 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.64■■□□□ 1.06
PKDCC-206ENST00000480099 PDE3BQ13370 1112 aa21.64■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 MRS2Q9HD23 443 aa21.64■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 KDRP35968 1356 aa21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 EXOC5O00471 708 aa21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 SBF2Q86WG5 1849 aa21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.61■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.6■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 NEFMP07197 916 aa21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 SPG7Q9UQ90 795 aa21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 CCDC184Q52MB2 194 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-206ENST00000480099 PRKAR2BP31323 418 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 FCHSD2O94868 740 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 ITGB4P16144 1822 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 MIER1Q8N108 512 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 FAM182BQ5T319 152 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 CCER2I3L3R5 266 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-206ENST00000480099 NHSQ6T4R5 1651 aa21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.49■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.49■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 CYP27B1O15528 508 aa21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 PHKG2P15735 406 aa21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 BTAF1O14981 1849 aa21.47■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.46■■□□□ 1.03
PKDCC-206ENST00000480099 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.45■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 RUNDC1Q96C34 613 aa21.45■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.45■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 EP400Q96L91 3159 aa21.45■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 MAP3K5Q99683 1374 aa21.44■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 BCL9O00512 1426 aa21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.42■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 TRIM37O94972 964 aa21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 NFE2L2Q16236 605 aa21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 DCAF5Q96JK2 942 aa21.4■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PKDCC-206ENST00000480099 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 NEUROD2Q15784 382 aa21.38■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 RIPK4P57078 832 aa21.36■■□□□ 1.01
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PKDCC-206ENST00000480099 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.36■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 APAF1O14727 1248 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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PKDCC-206ENST00000480099 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 KCNQ2O43526 872 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 CABP4P57796 275 aa21.34■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 MRC1P22897 1456 aa21.33■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 LY75O60449 1722 aa21.33■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 TEFQ10587 303 aa21.33■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 CCDC125Q86Z20 511 aa21.33■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 LGR6Q9HBX8 967 aa21.33■■□□□ 1.01
PKDCC-206ENST00000480099 MCM10Q7L590 875 aa21.32■■□□□ 1
PKDCC-206ENST00000480099 PAPPAQ13219 1627 aa21.31■■□□□ 1
PKDCC-206ENST00000480099 APBA3O96018 575 aa21.31■■□□□ 1
PKDCC-206ENST00000480099 DCTN1Q14203 1278 aa21.31■■□□□ 1
PKDCC-206ENST00000480099 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
PKDCC-206ENST00000480099 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.3■■□□□ 1
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