RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.62□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 RHOQP17081 205 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 COL8A1P27658 744 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 ZBTB33Q86T24 672 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 ZMYND10O75800 440 aa8.59□□□□□ -1.03
ANKRD28-210ENST00000479043 H7C1W4 665 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 MX2P20592 715 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 ITGB7P26010 798 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 LCE3BQ5TA77 95 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 MAP2K3P46734 347 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 PTK2Q05397 1052 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 ADAM32Q8TC27 787 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 GPC1P35052 558 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 RAB15P59190 212 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD28-210ENST00000479043 ESPNB1AK53 854 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM66O15016 1216 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GRIN2CQ14957 1233 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 POU4F2Q12837 409 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 NR6A1Q15406 480 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CD163Q86VB7 1156 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 KLRG1Q96E93 195 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 RRAGCQ9HB90 399 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CYLDQ9NQC7 956 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 BCANQ96GW7 911 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-210ENST00000479043 MEN1O00255 615 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 THBS1P07996 1170 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CHRNA4P43681 627 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NBPF15Q8N660 670 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 A0A1W2PRU2 124 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 WDR44Q5JSH3 913 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 GNB5O14775 395 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 F11P03951 625 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM52Q96A61 297 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PIK3R2O00459 728 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 DOC2BQ14184 412 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PHF24Q9UPV7 400 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-210ENST00000479043 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 AMPD1P23109 780 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 CLN3Q13286 438 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 AK7Q96M32 723 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 NLRP3Q96P20 1036 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 DGKGP49619 791 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 C2CD2LO14523 706 aa8.37□□□□□ -1.07
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